bawang - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

bawang - molecular visualization program

SINOPSIS

bawang [totoo Bawang pagpipilian] [X11 pagpipilian] [filename]

DESCRIPTION

Ang manu-manong pahinang ito ay maikli ang mga dokumento bawang, isang libreng molecular visualization program.
Ang malawak na dokumentasyon sa HTML na format at mga mapagkukunan ay maaaring matagpuan sa tahanan ng bawang,
<URL:http://garlic.mefos.hr/garlic/>. Pisikal na lokasyon: School of Medicine, Unibersidad
ng Osijek, Croatia, Europe. Mga precompiled na pakete para sa isang bilang ng mga distribusyon ng GNU/Linux
ay magagamit. Kabilang dito ang Debian, SuSE, Mandriva, Linspire at marami pang iba
mga distro. Ang dokumentasyong HTML ay maaaring i-download at i-unpack para sa lokal na paggamit (inirerekomenda
paggamit). Dito mahahanap mo ang isang napakaikling paglalarawan ng programa at ang listahan ng utos
mga pagpipilian sa linya.

bawang ay isang molecular visualization program na orihinal na isinulat para sa pagsisiyasat ng
mga protina ng lamad. Ngayon ay maaari itong magamit upang mailarawan at simpleng pag-edit ng lahat ng mga protina at
mga molekula. Kinikilala ng bersyong ito ang bersyon ng PDB format na 2.1; tingnan ang source file pdb_atom.c
para sa mga detalye tungkol sa format na ito.

Opsyon

Ang mga opsyon sa command line ay maaaring nahahati sa dalawang grupo: totoo (tiyak) bawang pagpipilian at X11
pagpipilian. Maaaring ibigay ang mga opsyon sa anumang pagkakasunud-sunod. Ang lahat ng mga opsyon at hard-coded default na halaga ay
nakalista sa talahanayan sa ibaba. Para sa bawat parameter, ang halaga na tinukoy sa pamamagitan ng command line ay
ginamit, kung magagamit. Kung hindi, tinukoy ang halaga sa .garlicrc file ay ginagamit. Kung .garlicrc
hindi available ang file, o walang katumbas na entry sa file na ito, ang hard-coded
ginagamit ang default na halaga. Ang sample .garlicrc file na kasama sa orihinal na pakete ay naglalaman ng
ang mga halaga ay katumbas ng mga hard-code na default.

bawang na pagpipilian:
-h, - Tumulong
Mag-print ng tulong at lumabas.

-sa, --bersyon
I-print ang bersyon at lumabas.

-r, --magparehistro
Magrehistro ng bawang: ipaalam sa may-akda na ang iyong site ay may naka-install na bawang at may isang tao
ay gagamit ng program na ito. Sa pamamagitan ng pagpaparehistro, hinihikayat mo ang may-akda na
ipagpatuloy ang pagbuo ng bawang. Maaari mo ring tulungan ang may-akda upang matiyak ang suporta para sa
karagdagang pag-unlad. Ang opsyong ito ay nagpapadala ng isang maikling mensaheng e-mail, na naglalaman lamang
ang e-mail message header at ang salitang 'Hi!',to[protektado ng email]>. Pakiusap
execute garlic -r kung gagamitin mo ang program na ito. Kung hindi ka konektado sa
sa Internet, isaalang-alang ang pagpapadala ng maikling mensahe mula sa ibang sistema.

-masungit Itago ang icon ng coordinate system (kaliwang sulok sa itaas).

-walang kontrol
Itago ang control window (kanang sulok sa itaas).

-stereo
Ipakita ang stereo na imahe.

-tilad paraan
Default na slab mode. Ang mga available na slab mode ay: naka-off, planar (default), sphere,
kalahating globo, silindro at kalahating silindro.

-kumukupas paraan
Default na color fading mode. Mga available na mode: off, planar (default), sphere,
kalahating globo, silindro at kalahating silindro.

-bilang numero
Default na istilo ng pagguhit ng atom (hard-coded default: 2).

-bs numero
Default na istilo ng pagguhit ng bono (hard-coded default: 2).

-fs numero
Default na bilang ng mga ibabaw na kumukupas ng kulay. Parallel planes, concentric sphere o
concentric cylinders ay maaaring gamitin bilang kumukupas na ibabaw. Tatlong RGB triplets ang
itinalaga sa bawat ibabaw. Ang mga ibabaw ay pantay-pantay; kahit isa at higit pa
dapat tukuyin ang walo. Hindi bababa sa tatlong kulay (kaliwa, gitna at kanan) ay
itinalaga sa bawat nakikitang atom. Ang tatlong kulay na ito ay batay sa posisyon ng a
ibinigay na atom na nauugnay sa pinakamalapit na (mga) kumukupas na ibabaw at sa mga kulay na itinalaga sa
mga ibabaw na ito. Ang mga kulay ay pinagsama gamit ang linear weighting.

-lc kulay
Kaliwang kulay sa i-th na ibabaw; ako ay nasa pagitan ng zero at pito. Ang string ng kulay
dapat na sumusunod sa X11R5. Ang asul, halimbawa, ay maaaring tukuyin bilang asul o bilang
RGB:0000/0000/FFFF atbp. Halimbawa -lc4 RGB:BBBB/8888/4444 ay tumutukoy sa kaliwang kulay
sa ibabaw na ang index ay katumbas ng apat.

-mc kulay
Gitnang kulay sa i-th na ibabaw.

-rc kulay
Tamang kulay sa i-th surface.

-pc, --print-config
I-print ang data ng configuration at lumabas.

-pcn I-print ang mga pangalan ng cursor upang mag-stdout at lumabas.

-log logfile
Sumulat ng mga utos at mensahe upang mag-log file. Ang file ay malilikha sa kasalukuyang
gumaganang direktoryo. Kung hindi ito posible, gagawin ang log file sa home ng mga user
direktoryo.

X11 opsiyon:
-display displayname
X server upang makipag-ugnayan.

-geometry geom
Geometry ng window (default: halos buong screen).

-bg kulay
Kulay ng background ng pangunahing window (itim ang default).

-fg kulay
Kulay ng foreground ng pangunahing window (default: puti).

-fn fontname
Font ng teksto; (Ang default ay 10x20).

-tbg kulay
Kulay ng background ng teksto (itim ang default).

-tfg kulay
Kulay ng teksto (default ay puti).

-cursor cursorname
Pangalan ng cursor; tingnan mo /usr/include/X11/cursorfont.h para sa mga pangalan; tanggalin ang XC_ prefix.

Gumamit ng bawang online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net