Ito ang command glam2scan na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
glam2scan - nakakahanap ng GLAM2 motif sa isang database
SINOPSIS
glam2scan [pagpipilian] alpabeto my_motif.glam2 my_seqs.fa
Isang alpabeto maliban sa p or n ay binibigyang kahulugan bilang pangalan ng isang alphabet file.
DESCRIPTION
glam2scan nakakahanap ng mga tugma, sa isang database ng sequence, sa isang motif na natuklasan ni glam2. Bawat isa
ang laban ay tumatanggap ng marka, na nagsasaad kung gaano ito kasya sa motif.
Opsyon (DEFAULT MGA SETTING)
-h
Ipakita ang lahat ng mga opsyon at ang kanilang mga default na setting.
-o
Output file (stdout).
-n
Bilang ng mga pagkakahanay na iuulat (25).
-2
Suriin ang parehong mga hibla - pasulong at baligtad na pandagdag.
-D
Pagtanggal ng pseudocount (0.1).
-E
Walang-pagtanggal na pseudocount (2.0).
-I
Insertion pseudocount (0.02).
-J
Walang-insertion pseudocount (1.0).
-d
Dirichlet mixture file.
Gumamit ng glam2scan online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
