Ito ang command na gmod_make_cvtermpath.plp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
gmod_make_cvtermpath.pl - kinakalkula ang transitive closure sa mga tuntunin ng ontology sa
talahanayan ng cvterm
PAGGAMIT
perl gmod_make_cvtermpath.pl -H [dbhost] -D [dbname] [-vt] -c cvname
perl gmod_make_cvtermpath.pl -g [GMODConf_profile] -c cvname
parameter
-c Pangalan ng ontology (cv.name) para kalkulahin ang transitive closure sa. (Kailangan)
-v Verbose na output
-t Trial mode. Huwag magsagawa ng anumang mga operasyon sa tindahan. (Hindi ipinatupad)
-o outfile para sa pagsusulat ng mga error at verbose na mensahe (opsyonal)
-g GMOD database profile name (maaaring magbigay ng host at DB name) Default: 'default'
If hindi paggamit a GMOD database profile (pagpipilian -g) pagkatapos ikaw dapat magbigay ang sumusunod
parameter
-D Pangalan ng database
-H Hostname
-d Pangalan ng driver ng database (hal. 'Pg' para sa mga postgres)
-u [Opsyonal- kung hindi ginagamit ang default na user] Pangalan ng user ng database
-p [Opsyonal- kung kailangan mo ng password para kumonekta sa iyong database] Password para sa iyong user
upang kumonekta sa database
DESCRIPTION
Kinakalkula ng script na ito ang transitive closure sa mga tuntunin ng ontology sa cvterm table.
Dahil isa itong computationally intensive operation, ginagawa ito sa isang malaking cv tulad ng Gene
Maaaring tumagal ng ilang oras ang ontology. Para sa higit pang impormasyon sa kung ano ang transative closure,
mangyaring tingnan ang:
http://www.geneontology.org/GO.database.shtml#graphs
Gamitin ang gmod_make_cvtermpath.plp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
