Ito ang command idconvert na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
idconvert — I-convert ang mga format ng file ng mass spectrometry identification.
SINOPSIS
idconvert [mga pagpipilian] [mga filemask]
DESCRIPTION
Ang manu-manong pahinang ito ay nagdodokumento ng maikling idconvert software na ipinadala sa loob ng libpwiz-tools
pakete. Ang program na ito ay nagpapahintulot sa isa na mag-convert ng mass spectrometry na data ng pagkakakilanlan ng protina
mga file mula sa isang format patungo sa isa pa.
Opsyon
-v | --verbose
Ipakita ang detalyadong impormasyon sa pag-unlad ng pagproseso.
-f | --filelist filename
Gumagamit ng nilalaman ng filename na naglilista ng mga filename.
-o | --labas dir
Itakda ang direktoryo ng output ('-' para sa stdout) sa dir. Bilang default, ang output
ang direktoryo ay '.' (iyon ay, ang kasalukuyang gumaganang direktoryo).
-c | --config filename
Itakda ang configuration file sa filename.
-e | --ext ext
Itakda ang extension ng mga output file sa ext. Maaaring mzid o pepXML o txt.
--mzIdentML
Sumulat mzIdentML format (default).
--pepXML Sumulat pepXML format.
--text Sumulat ng hierarchical teksto format.
HALIMBAWA
I-convert ang sequest.pepXML sa sequest.mzid
idconvert sequest.pepXML
I-convert ang mascot.mzid sa mascot.pepXML
idconvert maskot.mzid --pepXML
Gumamit ng configuration file
idconvert xtandem.pep.xml -c config.txt
RETURN VALUE
Ang bilang ng mga nabigong file.
Gumamit ng idconvert online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
