Ito ang command na kmc_tools-intersect na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
kmc_tools-intersect - kalkulahin ang intersection ng dalawang KMC database
SINOPSIS
kmc_tools bumalandra <output
[output_params]>
DESCRIPTION
Ang database ng output ay maglalaman lamang ng mga k-mers na naroroon sa parehong mga set ng input. Ang
ang counter value sa output database ay katumbas ng mas mababang counter value sa input.
Opsyon
Para sa bawat input mayroong karagdagang mga parameter:
-ci
ibukod ang mga k-mer na nagaganap na mas mababa sa beses
-cx
ibukod ang mga k-mer na nagaganap nang higit sa beses
Para sa output mayroong mga karagdagang parameter:
-ci
ibukod ang mga k-mer na nagaganap na mas mababa sa beses
-cx
ibukod ang mga k-mer na nagaganap nang higit sa beses
-cs
pinakamataas na halaga ng isang counter
Halimbawa
kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools intersect kmers1 -ci10 -cx200 kmers2 -ci4 -cx100 kmers1_kmers2_intersect -ci20 -cx150
Gumamit ng kmc_tools-intersect online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
