InglesPransesEspanyol

Ad


OnWorks favicon

mia-3dmotioncompica-nonrigid - Online sa Cloud

Patakbuhin ang mia-3dmotioncompica-nonrigid sa OnWorks na libreng hosting provider sa Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

Ito ang command mia-3dmotioncompica-nonrigid na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

PROGRAMA:

NAME


mia-3dmotioncompica-nonrigid - Non-linear na pagpaparehistro ng isang serye ng mga 3D na larawan.

SINOPSIS


mia-3dmotioncompica-nonrigid -i -o [mga pagpipilian]

DESCRIPTION


mia-3dmotioncompica-nonrigid Ang program na ito ay nagpapatupad ng 3D na bersyon ng paggalaw
compensation algorithm na inilarawan sa Wollny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ,
"Ang Automatic Motion Compensation ng Libreng Paghinga ay nakakuha ng Myocardial Perfusion Data sa pamamagitan ng
gamit ang Independent Component Analysis", Medical Image Analysis, 2012,
DOI:10.1016/j.media.2012.02.004.

Opsyon


File-IO
-i --in-file=(input, kinakailangan); io
pag-input ng mga larawan ng magkakasunod na bilang na naka-file (pangalanXXXX.ext) Para sa suportado
mga uri ng file tingnan ang PLUGINS:3dimage/io

-o --out-file=(output, kinakailangan); io
pangalan ng imahe ng output (bilang C format string kasama ang isang %04d upang tukuyin
ang file numbering) Para sa mga sinusuportahang uri ng file tingnan ang PLUGINS:3dimage/io

--save-refs=
i-save ang mga reference na imahe, ang ibinigay na string ay ginagamit bilang base ng pangalan ng file, ang
Ang pattern ng numero ay sumusunod sa mga imahe ng input, at ang format ng output ay palaging
'vista'

--save-regs=
i-save ang mga intermediate na rehistradong larawan, ang ibinigay na string ay ginagamit bilang pangalan ng file
base, ang pattern ng numero ay sumusunod sa mga imahe ng input, at ang format ng output ay
laging 'vista'

--save-coeffs=
i-save ang paghahalo ng matrix sa isang text file

--save-features=
i-save ang mga larawan ng tampok bilang PNG

Tulong & Impormasyon
-V --verbose=babala
verbosity ng output, pag-print ng mga mensahe ng ibinigay na antas at mas mataas na priyoridad.
Ang mga sinusuportahang priyoridad na nagsisimula sa pinakamababang antas ay:
info - Mga mensahe sa mababang antas
kopyahin o sipiin sa pamamagitan ng pag-aninag - Trace ng tawag sa function
mabigo - Mag-ulat ng mga pagkabigo sa pagsubok
babala - Mga babala
mali - Mag-ulat ng mga error
mag-alis ng mga insekto ‐ Debug na output
mensahe - Mga normal na mensahe
nakamamatay ‐ Iulat lamang ang mga nakamamatay na pagkakamali

--copyright
i-print ang impormasyon sa copyright

-h --tulong
i-print ang tulong na ito

-? --gamit
mag-print ng maikling tulong

--bersyon
i-print ang numero ng bersyon at lumabas

Ica
-C --mga bahagi=0
Mga bahagi ng ICA 0 = awtomatikong pagtatantya Mga bahagi ng ICA 0 = awtomatiko
kuru-kuro

--hindi-normalize
huwag gawing normal ang mga IC

--no-meanstrip
huwag hubarin ang ibig sabihin mula sa mga kurba ng paghahalo

-k --laktawan=0
laktawan ang mga larawan sa simula ng serye hal dahil tulad ng mga ito sa iba
modalitiesskip mga larawan sa simula ng serye hal dahil bilang sila
ay sa iba pang mga modalidad

-m --max-ica-iter=400
maximum na bilang ng mga iteration sa ICAmaximum na bilang ng mga iteration sa ICA

Pagproseso
--mga thread=-1
Maximum na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ang bilang na ito ay dapat na mas mababa
o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor sa makina. (-1:
awtomatikong pagtatantya). Pinakamataas na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ito
Ang numero ay dapat na mas mababa o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor
ang makina. (-1: awtomatikong pagtatantya).

rehistrasyon
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
Optimizer na ginagamit para sa minimization

-a --start-c-rate=32
simulan ang coefficinet rate sa mga spine, nahahati sa --c-rate-divider na may
bawat passstart coefficinet rate sa mga spine, nahahati sa --c-rate-divider
sa bawat pagpasa

--c-rate-divider=4
cofficient rate divider para sa bawat passcofficient rate divider para sa bawat pass

-d --start-divcurl=20
simulan ang divcurl weight, nahahati sa --divcurl-divider sa bawat passstart
divcurl weight, nahahati sa --divcurl-divider sa bawat pass

--divcurl-divider=4
divcurl weight scaling sa bawat bagong passdivcurl weight scaling sa bawat isa
bagong pass

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd,
gastos ng imahe

-l --mg-levels=3
mga antas ng multi-resolution na mga antas ng multi-resolution

-P --pasa=3
registration pass mga registration pass

MGA PLUGIN: 3dimage/io


suriin Suriin ang 7.5 na larawan

Mga kinikilalang extension ng file: .HDR, .hdr

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
unsigned 8 bit, sign 16 bit, sign 32 bit, floating point 32 bit,
lumulutang na punto 64 bit

datapool Virtual IO papunta at mula sa panloob na data pool

Mga kinikilalang extension ng file: .@

dicom Mga serye ng imahe ng Dicom bilang 3D

Mga kinikilalang extension ng file: .DCM, .dcm

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 16 bit, hindi nilagdaan ang 16 bit

hdf5 HDF5 3D na imahe IO

Mga kinikilalang extension ng file: .H5, .h5

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, hindi nalagdaan 32 bit, nilagdaan ang 64 bit, hindi nalagdaan 64 bit, lumulutang
point 32 bit, floating point 64 bit

inria Larawan ng INRIA

Mga kinikilalang extension ng file: .INR, .inr

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

mhd MetaIO 3D image IO gamit ang pagpapatupad ng VTK (pang-eksperimento).

Mga kinikilalang extension ng file: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

nifti NIFTI-1 3D na imahe IO

Mga kinikilalang extension ng file: .NII, .nii

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, signed 64 bit, unsigned 64 bit, floating point 32
bit, lumulutang na punto 64 bit

vff VFF Sun raster na format

Mga kinikilalang extension ng file: .VFF, .vff

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
unsigned 8 bit, sign 16 bit

tingnan 3D view

Mga kinikilalang extension ng file: .V, .VISTA, .v, .vista

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
kaunti

VTI 3D na larawang VTK-XML sa- at output (pang-eksperimento).

Mga kinikilalang extension ng file: .VTI, .vti

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

vtk 3D VTK image legacy sa- at output (pang-eksperimento).

Mga kinikilalang extension ng file: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
kaunti

Halimbawa


Irehistro ang serye ng perfusion na ibinigay sa mga larawang imagesXXXX.v gamit ang 4-class na ICA
pagtatantya. Laktawan ang dalawang larawan sa simula, gumamit ng hindi hihigit sa 4 na thread ng pagpaparehistro, isang nlopt
based optimizer at kung hindi man ay gamitin ang mga default na parameter. Itago ang resulta sa
nakarehistroXXXX.v

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i images0000.v -o registered%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

AUTHOR(s)


Gert Wollny

COPYRIGHT


Ang software na ito ay Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germany at Madrid, Spain. Dumating ito
na WALANG WARRANTY at maaari mo itong muling ipamahagi sa ilalim ng mga tuntunin ng GNU
PANGKALAHATANG PUBLIC LICENSE Bersyon 3 (o mas bago). Para sa karagdagang impormasyon, patakbuhin ang programa gamit ang
opsyon na '--copyright'.

Gumamit ng mia-3dmotioncompica-nonrigid online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net


Mga Libreng Server at Workstation

Mag-download ng Windows at Linux apps

Linux command

Ad