micalc - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

micalc - Nagsasagawa ng pangunahing matematika gamit ang mga set ng data

DESCRIPTION

micalc: Nagsasagawa ng basic mathematics gamit ang mga data set

Ang mga format ng file ay awtomatikong nakikilala sa pamamagitan ng kanilang extension ng file. Para sa binary
mga operasyon na may dalawang input file, ang protocol ng unang input file ay gagamitin
para sa output file.

micalc maaari be ginamit in isa of ang sumusunod mga mode:
Binary na operasyon na may mga set ng data at/o mga scalar na numero:

micalc [-if1 | -in1 ] -op
[-kung2 | -in2
] -ng

Akumulasyon ng isang set ng data:

micalc -kung -op

Pagbabago (magnitude, logarithm, negation, inversion, o acos) ng isang data
itakda:

micalc -kung -op -ng

Mga istatistika ng isang set ng data:

micalc -kung [-ibig sabihin ] [-stdev ] [-fluct
] [-tcourse ][-hist
-histslots [-histmin ] [-histmax ]
[-rightstairs] [-histfract] [-loghist] ]

dagdag na pagpipilian:
-maskara

talaksan basahin na pagpipilian:
-petsa: Petsa ng pag-scan [yyyymmdd] (default=20140807yyyymmdd)

-fp: FOV sa direksyon ng phase [mm] (default=220.0mm)

-fr: FOV sa read direction [mm] (default=220.0mm)

-fs: FOV sa direksyon ng slice [mm] (default=5.0mm)

-nr: Bilang ng magkakasunod na sukat (default=1)

-nx: Bilang ng mga punto sa direksyon ng pagbasa (default=128)

-ny: Bilang ng mga punto sa direksyon ng phase (default=128)

-nz: Bilang ng mga puntos sa direksyon ng slice (default=1)

-kapanganakan: Petsa ng kapanganakan ng mga pasyente [yyyymmdd] (default=00000000yyyymmdd)

-pid: Natatanging identifier ng pasyente (default=Hindi Alam)

-pname: Buong pangalan ng pasyente (default=Hindi alam)

-psex: Kasarian ng mga pasyente (options=MFO , default=O)

-pweight: Timbang ng mga pasyente [kg] (default=50.0kg)

-siyentipiko: Pangalan ng Siyentipiko (default=Hindi Alam)

-sd: Inter-slice distance (mula sa gitna hanggang gitna) [mm] (default=10.0mm)

-serd: Paglalarawan ng Serye (default=Hindi Alam)

-serno: Numero ng Serye (default=1)

-st: Kapal ng hiwa [mm] (default=5.0mm)

-stud: Paglalarawan ng Pag-aaral (default=Hindi Alam)

-tcname: Pangalan ng transmit coil (default=Unknown)

-tsaa: Time-to-echo ng sequence [ms] (default=80.0ms)

-panahon: Oras ng pag-scan [hhmmss] (default=091012hhmmss)

-tr: Oras sa pagitan ng magkakasunod na paggulo [ms] (default=1000.0ms)

-cplx: Tratuhin ang data bilang kumplikado at i-extract ang ibinigay na bahagi (options=none abs pha real
imag , default=wala)

-ds: Dataset index upang i-extract kung maraming dataset ang nabasa

-filter: Basahin lamang ang mga dataset na 'key' ng parameter ng protocol na naglalaman ng string
'value' (ibinigay sa format na 'key=value')

-fmap: Para sa pinababang paggamit ng memorya, panatilihin ang pag-file ng mapping pagkatapos basahin ang (raw) na data, ngunit sumulat
sa array ay magreresulta sa isang pag-crash

-jdx: Kung marami ang JDX arrays, piliin ito

-diyalekto: Basahin ang data gamit ang ibinigay na diyalekto ng format. (default ay walang dialect)

-Rf: Basahin ang format, gamitin ito para i-override ang extension ng file (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=autodetect)

-laktawan: Laktawan ang dami ng byte na ito bago basahin ang raw data (default=0)

talaksan magsulat na pagpipilian:
-dugtungan: Idagdag sa umiiral na file, para lamang sa raw data

-fnamepar: Space-separated na listahan ng mga parameter ng protocol na isasama kapag gumagawa ng natatangi
mga pangalan ng file

-noscale: Huwag muling sukatin ang mga halaga kapag nag-iimbak ng mga integer

-hati: Piliting hatiin ang mga pares ng protocol-data sa magkahiwalay na mga file.

-Uri: Uri ng representasyon ng larawan (mga opsyon=awtomatikong float double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit , default=awtomatiko)

-wdialect: Sumulat ng data gamit ang ibinigay na diyalekto ng format. (walang dialect ang default)

-wf: Sumulat ng format, gamitin ito upang i-override ang extension ng file (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=autodetect)

-wp: Itabi ang protocol nang hiwalay sa file na ito.

Mga filter Inilapat sa input mga file) at maskara:
-align : I-align ang data sa geometry (mga lokasyon ng voxel) ng
isang panlabas na file

-automask : Gumawa ng mask gamit ang awtomatikong histogram-based threshold

-kumpol : Gumawa ng mga kumpol ng non-zero na katabi/susunod na mga voxel na kapitbahay, pinagsunod-sunod ayon sa laki

-magsama <convolution kernel (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ), diameter ng kernel [mm]> : Convolution sa spatial na sukat

-detrend <Bilang ng mga bahaging mababa ang dalas na aalisin,Zero ang ibig sabihin ng magreresulta
timecourse> : Alisin ang mabagal na drift sa paglipas ng panahon

-edit <Position/range string sa format (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),bagong value
ng voxel> : I-edit ang mga solong halaga ng voxel

-genmask : Gumawa ng mask kasama ang lahat ng voxel na may halaga
sa ibinigay na hanay

-isotrop : gumawa ng mga voxel ng imahe na isotrop sa pamamagitan ng interpolation (image
hindi magbabago ang geometry)

-lowpass : Pag-filter ng lowpass

-max : I-clip ang lahat ng value sa itaas ng maximum na halaga

-maxip : Magsagawa ng maximum na intensity projection
higit sa ibinigay na direksyon

-pagsanib : Pagsamahin ang mga dataset sa iisang dataset sa pamamagitan ng pagpapalawak ng dimensyon ng oras

-min : I-clip ang lahat ng value sa ibaba ng minimum na halaga

-minip : Magsagawa ng minimum na intensity projection
higit sa ibinigay na direksyon

-noNaN : Pinapalitan ang bawat NaN ng ibinigay na halaga

-pflip : I-flip ang data sa direksyon ng phase

-prange : Piliin ang saklaw sa
direksyon ng yugto

-proj : Magsagawa ng mean projection sa ibinigay
utos

-quantilmask : Gumawa ng mask kasama ang lahat ng voxel sa itaas ng ibinigay na fractional
threshold

-sample : Temporal na pagbabago ng data ng imahe

-palitin ang sukat : Spatial na pagbabago ng laki ng data ng imahe

-reslice : reslices ang imahe sa isang ibinigay
paglagay sa lugar

-rflip : I-flip ang data sa read direction

-bulok : Pag-ikot sa eroplano

- ayusin : Piliin ang saklaw sa
basahin ang direksyon

-scale : I-rescale ang mga halaga ng imahe

-sflip : I-flip ang data sa direksyon ng slice

-shift <readDirection shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[pixel]> : Ilipat ang data nang spatially

-slicetime : Tama para sa
iba't ibang mga punto ng oras ng pagkuha ng mga hiwa

-pagdugtong : pinagdugtong ang
larawan sa ibinigay na direksyon

-srange : Piliin ang saklaw sa
direksyon ng paghiwa

-swapdim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : magpalit/magpakita ng mga dimensyon sa pamamagitan ng pagtukoy ng direksyon
triple na may kasamang opsyonal na reflection sign

-tile : Pagsamahin ang mga hiwa sa isang parisukat na 2D na imahe

-kakaiba : Piliin ang saklaw sa
direksyon ng oras

-shift : Ilipat ang data sa oras

-typemax : I-clip ang lahat ng value sa itaas ng maximum ng isang partikular na uri ng data

-typemin : I-clip ang lahat ng value sa ibaba ng minimum na uri ng data

-usemask : Gumawa ng 1D na dataset kasama ang lahat ng value sa loob ng mask mula sa file

iba na pagpipilian:
-v o para sa pag-debug/pagsubaybay sa lahat ng mga bahagi o isang solong
component, ayon sa pagkakabanggit. Ang mga posibleng value para sa loglevel ay: 0(noLog), 1(errorLog),
2(warningLog), 3(infoLog).

-h, - Tumulong, -tulong, --bersyon : I-print ang teksto ng tulong o impormasyon ng bersyon

Suportadong file mga extension(mga format):
3db (Iris3D binary data)

suriin
(NIFTI/ANALYZE, mga diyalekto: fsl )

asc (ASCII, mga diyalekto: tcourse )

coi (mga set ng data ng JCAMP-DX)

dat (Matlab ascii 2D data matrix)

dcm (DICOM, mga diyalekto: siemens )

doble (dobleng raw data)

lumutang (float raw data)

gz (GNU-Zip container para sa iba pang mga format)

hdr (Interfile, mga diyalekto: neurostat )

hdr (NIFTI/ANALYZE, mga diyalekto: fsl )

idx (3D-index ng mga hindi zero sa ASCII)

ima (DICOM, mga diyalekto: siemens )

interfile
(Interfile, dialects: neurostat )

jdx (JCAMP-DX na format ng imahe)

mag (DICOM, dialects: siemens )

mhd (MetaImage)

nii (NIFTI/ANALYZE, mga diyalekto: fsl )

ph (DICOM, mga diyalekto: siemens )

png (Portable Network Graphics)

pos (xy na mga posisyon ng mga hindi zero sa ASCII)

pro (mga protocol sa pagsukat ng ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (nalagdaan 16 bit raw data)

s32bit (nalagdaan 32 bit raw data)

s8bit (nalagdaan 8 bit raw data)

smp (mga set ng data ng JCAMP-DX)

u16bit (unsigned 16 bit raw data)

u32bit (unsigned 32 bit raw data)

u8bit (unsigned 8 bit raw data)

Gumamit ng micalc online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net