Ito ang command pregap4 na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
pregap4 - maghanda ng raw data mula sa sequencing instruments para magamit sa gap4 (bahagi ng staden
pakete)
DESCRIPTION
Bago makapasok sa isang database ng gap4 ang raw data mula sa mga instrumento sa pagkakasunud-sunod ay kailangang
dumaan sa ilang proseso, gaya ng screening para sa mga vector, pagsusuri ng kalidad, at
conversion ng mga format ng data. Ginagamit ang Pregap4 upang ipasa ang isang batch ng mga pagbabasa sa mga ito
mga hakbang sa awtomatikong paraan. Nagbibigay ito ng interface para sa pag-set up at pag-configure ng
pagproseso at para sa pagkontrol sa pagpasa ng mga pagbasa sa bawat yugto. Ang
Ang mga hiwalay na gawain ay tinatawag na "mga module" at ang bawat module ay karaniwang pinamamahalaan ng isang nakatuon
programa. Binabalot ng Pregap4 ang lahat ng mga module na ito sa isang madaling gamitin na kapaligiran, habang
pagpapanatili ng kakayahang umangkop upang piliin at palawigin ang mga module sa pagpoproseso. Ito ay isang, bilang
gayunpaman, hindi nai-publish na kapalit ng programa pregap Bonfield, JK at Staden, R.
Mga eksperimento na file at ang kanilang aplikasyon sa panahon ng malakihang sequencing na mga proyekto. DNA
Sequence 6, 109-117 (1996).
Gamitin ang pregap4 online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
