Ito ang Linux app na pinangalanang CSBB-v3.0 na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang CSBB-v3.0.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang CSBB-v3.0 gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
CSBB-v3.0
Ad
DESCRIPTION
Ang CSBB ay isang command line-based na bioinformatics suite upang suriin ang biological data na nakuha sa pamamagitan ng iba't ibang paraan ng biological na mga eksperimento. Ang CSBB ay ipinatupad sa Perl, habang ginagamit din nito ang paggamit ng R, java, python at ruby sa background para sa mga partikular na module. Ang pangunahing pokus ng CSBB ay ang payagan ang mga user mula sa biology at bioinformatics na komunidad, na makinabang sa pamamagitan ng pagsasagawa ng mga down-stream analysis na gawain habang inaalis ang pangangailangang magsulat ng programming code. Ang CSBB ay kasalukuyang magagamit sa Linux, UNIX.Sa kasalukuyan, ang CSBB ay nagbibigay ng 18 module na nakatuon sa analytical na mga gawain tulad ng pagsasagawa ng upper-quantile normalization, interactive visualization at susunod na henerasyon na sequencing pipelines. Ang CSBB ay mayroon na ngayong kakayahan na magproseso ng pampublikong data. Pagbibigay sa User ng End to End pipeline na karanasan.
Mga tampok
- RNA-Seq
- ChIP-Seq
- ATAC-Seq
- Normalisasyon
- Differential Expression
- Pampublikong Pagproseso ng Data
- End to End Pipelines
- Open Source
- Paggunita
- bioinformatics
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
Perl
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
