Ito ang Linux app na pinangalanang FusionCatcher na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang fusioncatcher_v1.20.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang FusionCatcher upang tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
FusionCatcher na tumakbo sa Linux online
Ad
DESCRIPTION
Ang FusionCatcher ay naghahanap ng mga nobela/kilalang somatic fusion genes, pagsasalin, at chimera sa RNA-seq data (pinares-end reads mula sa mga platform ng Illumina NGS tulad ng Solexa at HiSeq) mula sa mga sample na may sakit.Ang mga layunin ng FusionCatcher ay:
- napakahusay na rate ng pagtuklas para sa paghahanap ng mga gen ng fusion ng kandidato,
- napakadaling gamitin (ibig sabihin, walang a priori na kaalaman sa mga database at bioinformatics ay kailangan upang patakbuhin ang FusionCatcher),
- napakahusay na pagtuklas ng mga mapaghamong fusion genes, tulad ng mga IGH fusion, CIC fusion, DUX4 fusion, CRLF2 fusion, TCF3 fusion, atbp.
- upang maging awtomatiko hangga't maaari (ibig sabihin, awtomatikong pipiliin ng FusionCatcher ang pinakamahusay na mga parameter upang mahanap ang mga gen ng pagsasanib ng kandidato, hal. awtomatikong paghahanap ng mga adapter, awtomatikong pagbuo ng mga exon-exon junction batay sa haba ng mga nabasang input, atbp.) habang nagbibigay ng pinakamahusay na posibleng rate ng pagtuklas para sa paghahanap ng mga fusion genes.
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
Sawa
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/fusioncatcher/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
