Ito ang Linux app na pinangalanang iMSAT na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang SSRs.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang iMSAT para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
iMSAT na tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang iMSAT ay kumakatawan sa isang buong update ng vcf2MSAT program. Ang command line python program na ito ay nagbibigay-daan para sa isang user na gamitin ang polymorphism data na nabuo gamit ang SAM- at BAM-tools at isang .fasta alignment file upang maghanap ng mga polymorphic microsatellite marker (MSATs o STRs). Sa pamamagitan ng pagtukoy sa mga gumagawa ng polymorphic, sa halip na mga simpleng umuulit na rehiyon tulad ng ginawa ng mga nakaraang programa, lubos na pinapataas ng iMSAT ang bilis kung saan matutukoy ang mga polymorphic MSAT -- nakakatipid ng mahalagang oras at pera sa mga mananaliksik. Bisitahin http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract para sa pdf na artikulo na naglalarawan sa utility ng iMSAT at kung gagamitin mo ang program mangyaring banggitin ang artikulong ito bilang: Andersen at Mills: iMSAT: isang nobelang diskarte sa pagbuo ng microsatellite loci gamit ang mga barcoded na Illumina na aklatan. BMC Genomics 2014 15:858.Mga tampok
- Polymorphic Microsatellite Identification
- Pagsusunod-sunod ng Illumina
- Pagsusuri ng Genomic
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Sawa
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/imsat/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
