Ito ang Linux app na pinangalanang KMC-KaiC na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang KMC_KaiC_Original.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang KMC-KaiC sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
KMC-KaiC
DESCRIPTION
Ang code na ito ay isang nakalaang Kinetic Monte Carlo (KMC) algorithm na ginagaya ang isang modelo ng post-translational na Kai circadian clock.
Binibigyang-daan ka ng code na gayahin ang Kai system sa antas ng mga indibidwal na KaiC hexamer at monomer at tahasang sinusubaybayan ang turnover ng bawat ATP nucleotide. Bukod sa ATP hydrolysis, lahat ng reaksyon ay sumusunod sa detalyadong balanse.
Ang aplikasyon ng code ay inilarawan sa aming artikulo na pinamagatang "Isang Thermodynamically consistent na modelo ng post-translational Kai circadian clock", na malayang makukuha sa open access journal na PLOS Computational Biology:
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005415
*UPDATE* Gumawa kami ng ganap na nababaligtad na bersyon ng aming modelo, kabilang ang mga kabaligtaran na reaksyon para sa ATP hydrolysis. Ginagawa nitong posible na patakbuhin ang modelo sa thermodynamic equilibrium. Maaaring ma-download ang bersyong ito ng modelo sa ilalim ng KMC_KaiC_Rev.zip.
Kung gusto mong gamitin ang aming modelo para sa iyong sariling pananaliksik, mangyaring banggitin ang aming PLoS Computational Biology na papel.
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
C + +
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/kmc-kaic/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
