Ito ang Linux app na pinangalanang MendelChecker na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang MendelChecker_v2.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang MendelChecker sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MendelChecker
Ad
DESCRIPTION
Ang MendelChecker ay isang sukat na nakabatay sa posibilidad ng paghihiwalay ng Mendelian ng Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) sa mga nuclear pedigrees. Binuo namin ang paraang ito bilang sukatan ng kontrol sa kalidad para sa pagtuklas ng variant ng nobela mula sa maingay na data ng sequencing ng susunod na henerasyon sa mga pedigree, gaya ng Restriction site-associated DNA Sequencing (RAD-seq) sa mga non-model na organismo. Ang pamamaraang ito ay nagpapatupad ng paghahambing ng heterogametic vs. homogametic transmission, ibig sabihin, sex linked vs. autosomal segregation.
Mga tampok
- Sukatin ang posibilidad ng paghahatid ng Mendelian sa mga pedigree
- Autosome vs. sex chromosome assignment
- Binabasa ang karaniwang output ng GATK
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.