Ito ang Linux app na pinangalanang misc genomics tool na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang misc_genomics_tools_v0.2.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na may pangalang misc genomics tool gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
misc genomics tool
DESCRIPTION
Ito ay isang koleksyon ng iba't ibang mga programa na binuo sa kurso ng isang proyektong genomics, na kinasasangkutan ng Pseudomonas strain NCIMB10586
Kabilang dito ang
* pagtukoy at pagwawasto ng mga error sa isang (hal.) pacbio genome sequence gamit ang illumina reads
* prokaryotic sequence/genome annotation
* RNAseq analysis - normalisasyon at pagsasama-sama ng maraming sample bilang isang grupo
* RNAseq visualization
Ang lahat ng mga script ay ibinigay sa isang 'pinakamahusay na pagsisikap' na batayan, gayunpaman dahil sa iba't ibang mga pagbabago sa system hindi ko ginagarantiya na ang lahat ng mga file ay ang bersyon na ginamit sa pagsusuri.
Gayundin, mangyaring magkaroon ng kamalayan na ang mga ito ay lubos na binuo nang may pag-iisip - iyon ay, ang proseso ay inaasahang isasagawa sa huling anyo nito nang isang beses; maliit na pangangalaga ang ibinigay sa pag-optimize ng runtime o pag-chain ng mga script nang magkasama, at kung minsan ang mga panlabas na mapagkukunan ay manu-manong ina-access.
Mga tampok
- Pagwawasto ng error sa pagkakasunud-sunod ng genome
- Prokaryotic sequence annotation
- RNAseq normalization ng maramihang mga sample bilang isang grupo
- RNAseq sample series/time-course visualization
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
Perl
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
