Ito ang Linux app na pinangalanang Molecular Dynamics Studio na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang WindowsRelease.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Molecular Dynamics Studio na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Molecular Dynamics Studio
DESCRIPTION
Ito ay isang koleksyon ng mga pagbabago sa software na ginawa upang pagsamahin ang NanoEngineer-1, PACKMOL at MSI2LMP para sa layunin ng madaling paglikha ng mga molecular dynamics na selula. Ang NanoEngineer-1 ay isang molecular CAD software na isinulat ni Nanorex at nagbibigay sa user ng madaling paraan upang lumikha ng mga molecule, habang ang mga pagbabago sa software ay nagpapahintulot sa user na mag-type ng mga atom gamit ang maraming force field. Maaaring makabuo ang PACKMOL ng random na koleksyon ng mga molekula gamit ang mga template ng molekula mula sa NanoEngineer-1 kaya nagbibigay ng paunang MD cell. Ang mga pagbabago sa PACKMOL ay nagbibigay-daan sa data ng uri ng atom na maipasa sa software ng MSI2LMP. Gumagawa ang MSI2LMP ng LAMMPS input file batay sa class I o class II force field. Ang MSI2LMP ay binago upang gumamit ng numerically coded force field data na nabuo ng NanoEngineer-1. Ang format ng MMP file ay pinalawak at isinama sa lahat ng tatlong software application.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Mga tampok
- Molecular CAD na kakayahan sa pamamagitan ng NanoEngineer-1
- Manu-manong i-type ang mga atom batay sa CFF91 Atomistic force field
- Lumikha ng mga template ng molekula gamit ang NanoEngineer-1
- Bumuo ng MD cell gamit ang PACKMOL at maramihang mga template ng molekula
- Bumuo ng LAMMPS Geometry Input File gamit ang MSI2LMP
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
OpenGL, Qt
Wika ng Programming
Fortran, Python, C++, C
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.