Ito ang Linux app na pinangalanang SplitMEM na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang splitmem.1.0.tgz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang SplitMEM na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
SplitMEM
Ad
DESCRIPTION
Sa pagtaas ng mga pinahusay na teknolohiya sa pagkakasunud-sunod, ang genomics ay lumalawak mula sa isang solong reference sa bawat species paradigm sa isang mas komprehensibong pan-genome na diskarte na may maraming indibidwal na kinakatawan at sinuri nang magkasama. Dito ipinakilala namin ang isang nobelang O(n log n) time and space algorithm na tinatawag na splitMEM, na direktang bumubuo ng compressed de Bruijn graph para sa pan-genome ng kabuuang haba n. Upang makamit ang pagiging kumplikado ng oras na ito, dinadagdagan namin ang puno ng suffix na may mga paglaktaw ng suffix, isang bagong konstruksyon na nagbibigay-daan sa amin na dumaan sa ilang mga link ng suffix sa pare-parehong oras, at gamitin ang mga ito upang mahusay na mabulok ang mga pinakamaraming eksaktong tugma (MEM) sa panahon ng isang traversal ng suffix tree.
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
C + +
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/splitmem/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.