Ito ang Linux app na pinangalanang VIGOR3 na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang VIGOR3.tgz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang VIGOR3 para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
VIGOR3 na tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang VIGOR ay isang tool para sa pag-annotate ng mga coding genes sa mga viral genome. Ito ay binuo nina Jeffrey Hoover at Shiliang Wang para sa The JCVI Genomic Sequencing Center for Infectious Diseases (GSCID).http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
makipag-ugnay:
Jeff Hoover
301-540-7858
[protektado ng email]
Mga tampok
- nauunawaan ang pag-edit ng RNA, ribosomal slippage, ihinto ang read-thru ng codon at mga alternatibong start codon
- nag-annotate ng mga mature na peptide sa polyproteins
- pinangangasiwaan ang mga spliced, overlapping, at embedded genes
- humahawak ng circular, partial, at draft (gapped) genome
- sinusuri ang mga frameshift sa pagpupulong
- may kasamang mga reference na dataset para sa higit sa 50 species
- may kasamang mga tool para sa paglikha ng mga bagong reference na dataset
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Perl
Kapaligiran ng Database
SQLite
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/vigor3/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
