Ito ang Windows app na pinangalanang Gen3D na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang gen3d.cpp. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Gen3D na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA LALAKI
Ad
Gen3D
DESCRIPTION
Ang Gen3D ay isang application na idinisenyo upang matukoy ang tatlong-dimensional na genome at chromosome na mga modelo. Gumagamit ito ng chromosomal contact data upang bumuo ng mga three-dimensional na conformation. Ang pamamaraang ito ay maaaring makabuo ng mga three-dimensional na chromosomal na modelo na nagbibigay-kasiyahan sa malaking bahagi ng mga chromosomal contact.
Ang software ay binuo sa Bioinformatics, Data Mining at Machine Learning Laboratory ni Prof. Jianlin Cheng sa Computer Science Department sa University of Missouri - Columbia, USA. Ang proyekto ay sinusuportahan ng National Science Foundation (grant no. DBI1149224).
Kung gumagamit ka ng Gen3D sa iyong pananaliksik, mangyaring banggitin:
Nowotny, Jackson, Sharif Ahmed, Lingfei Xu, Oluwatosin Oluwadare, Hannah Chen, Noelan Hensley, Tuan Trieu, Renzhi Cao, at Jianlin Cheng. "Iterative reconstruction ng three-dimensional models ng human chromosomes mula sa chromosomal contact data." BMC bioinformatics 16, hindi. 1 (2015): 338.
Mga tampok
- Gumamit ng chromosomal contact data na nakuha gamit ang Hi-C technique
- Bumuo ng 3D structural genome at chromosome na mga modelo mula sa chromosomal contact data
- Simulan ang mga coordinate gamit ang probabilistic approach
- Bagong paraan upang kumatawan sa mga nasisiyahang contact sa heat map matrix
- Mga scheme ng pagmamarka upang malaman ang mga contact na malalayo at maikling hanay
- Kumpara sa iba pang umiiral na pamamaraan at napatunayan din sa mga tampok na genome
Audience
Agham/Pananaliksik, Engineering
Wika ng Programming
C + +
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/gen3d/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.