Ito ang Windows app na pinangalanang GESPA na tatakbo sa Windows online sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang GESPA.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang GESPA upang tumakbo sa Windows online sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA LALAKI
Ad
Ang GESPA ay tatakbo sa Windows online sa Linux online
DESCRIPTION
Ang GESPA (GEnomic Single nucleotide Polymorphism Analyzer) ay isang bioinformatics tool para sa pag-uuri ng Nonsynonymous Single Nucleotide Polymorphism (nsSNPs). Hinuhulaan ng GESPA kung pathogenic ang isang nsSNP gamit ang mga ulat mula sa literatura at iba't ibang algorithm para masuri ang konserbasyon sa orthologous at paralogous na mga alignment ng protina. Gamit ang mga ulat mula sa panitikan, nahuhulaan din ng GESPA ang phenotype ng isang nsSNP na may mataas na katumpakan. Ang software ay maaaring magamit sa klinikal upang matukoy kung ang mga naobserbahang nsSNP ay nauugnay sa sakit. Isang host ng mga anotasyon ang ibinigay: orthologous at paralogous na multiple sequence alignment, UCSC annotation, mga ulat na nagdedetalye ng konserbasyon ng isang nsSNP sa mga alignment, at mga link sa panlabas na nsSNP at impormasyon ng gene gaya ng mga nauugnay na publikasyon. Ang GESPA ay konektado sa isang patuloy na pag-update ng SQL server na nagbibigay-daan para sa mabilis na pagkuha ng data. TANDAAN: nangangailangan ng Java 1.7.0+. Ang Port 1433 ay hindi ma-block ng firewall, network, o antivirus program.Mangyaring banggitin: http://tinyurl.com/oj7p84a
Mga tampok
- Inuuri ang mga nsSNP ayon sa pathogenicity na may sensitivity na 96.3%, specificity ng 79.3%, at balanseng accuracy na 87.8%
- Maaaring gamitin sa klinikal upang matukoy ang panganib para sa mga sakit na dulot ng mga nsSNP
- Nahuhulaan nang tama ang nsSNP phenotype 96% ng oras kapag available ang data
- Nagbibigay ng mga kapaki-pakinabang na anotasyon kabilang ang mga anotasyon ng UCSC Genome Browser, homologous nucleotide at protina na multiple sequence alignment, panlabas na nsSNP at impormasyon ng gene (hal. mga publikasyon)
- Nakakonekta sa patuloy na pag-update ng SQL Server na nagbibigay-daan para sa mabilis na pagkuha ng data at napapanahon na impormasyon
- Nagbibigay-daan para sa maraming gamit na input ng nsSNP: lokasyon ng amino acid na may pagbabago, numero ng pag-access ng dbSNP, lokasyon ng nucleotide na may pagbabago, pagkakasunud-sunod ng nucleotide flanking na may pagbabago
- Nagbibigay-daan ang mga setting para sa kontrol ng phenotype prediction, pathogenicity prediction, paralogous genes, at SQL server data retrieval
- Sinusuportahan ang mga batch file
Audience
Industriya ng Pangangalagang Pangkalusugan, Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Java Swing
Wika ng Programming
Java
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/gespa/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
