Ito ang Windows app na pinangalanang MCPerm: Monte Carlo SNP permutation na tumakbo sa Windows online sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang MCPerm_1.1.2.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang MCPerm: Monte Carlo SNP permutation na tumakbo sa Windows online sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MCPerm: Monte Carlo SNP permutation na tumakbo sa Windows online sa Linux online
Ad
DESCRIPTION
MCPerm: Isang paraan ng permutasyon ng Monte Carlo para sa maramihang pagsubok na ugnayan sa pag-aaral ng case-control associationAng tradisyunal na permutation (TradPerm) na pagsubok ay isang mahalagang non-parametric na paraan ng pagsusuri na maaaring ituring bilang gold standard para sa maraming pagwawasto sa pagsubok sa case-control association na pag-aaral. Gayunpaman, umaasa ito sa orihinal na solong nucleotide polymorphism (SNP) genotypes at phenotypes data upang magsagawa ng isang malaking bilang ng mga random shuffles, at sa gayon ito ay computationally intensive, lalo na para sa genome-wide association study (GWAS). Upang mapahusay ang bilis ng pagkalkula nang hindi binabago ang laki ng TradPerm p-value, bumuo kami ng Monte Carlo permutation (MCPerm) na paraan bilang isang mahusay na alternatibo sa TradPerm.
Mga Paraan: Hindi kailangang i-shuffle ng MCPerm ang orihinal na data ng genotype at phenotypes. Gumagamit ito ng pamamaraang Monte Carlo, gumagamit ng dalawang-hakbang na hypergeometric distribution upang makabuo ng random na bilang ng mga genotype (AA, Aa at aa) sa mga kaso at kontrol.
Wika ng Programming
S / R
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/mcperm/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
