Ito ang Windows app na pinangalanang Pysimony na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang Pysimony.py. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Pysimony sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
Pysimony
Ad
DESCRIPTION
I-UPDATE: Pagkatapos ng ilang pag-aayos ng bug, tinanggal ko ang Pysimony para sa Javamony: https://sourceforge.net/projects/javamony/
Dahil sa kagandahan ni Python, alam kong balang araw ay kailangan kong tapusin ang Pysimony.
Ang unang pagtatangka ng isang mag-aaral sa isang phylogenetic inference program, na nakasulat sa simple ngunit eleganteng Python.
Nagbabasa si Pysimony ng FASTA file (ATGC lang ang tinanggap) na tinukoy bilang ang tanging argumento nito. Ang pangunahing pagsusuri ay nagpakita na ito ay mabagal, hindi tumpak at pinaka-tiyak na hindi epektibo. Ang isang hindi malamang na-na-the-most-parsimonious tree ay naka-print kapag nakumpleto sa pangunahing format ng Newick tree.
Dahil ang lahat ng bahagi ng programa ay orihinal na gawain ng isang baguhan na programmer, ito ay maaaring kumakatawan sa isa sa mga pinakamasamang paraan sa paglutas ng phylogenetic na problema. Malinaw kong iniiwasan ang object-oriented programming.
Gayunpaman, ipinamahagi ko ang pag-iisip na ito ay maaaring balang araw ay bahagyang pang-edukasyon o hindi bababa sa pagtawa sa kalunus-lunos na pagtatangka na ginagawa nitong muling likhain ang gulong
Mga tampok
- Maling parsimony calculator
- Nagbabasa ng mga file ng FASTA (ATGC lang)
- Outputs tree sa Newick format
- Simple, single mode
Audience
Agham/Pananaliksik, Edukasyon
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Sawa
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/pysimony/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
