Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen bam2fastx komutudur.
Program:
ADI
bam2fastx - bam'ı doğrudan fastx'e dönüştüren tophat bileşeni
SİNOPSİS
bam2fastx [--fasta|-a|--fastq|-q] [--renk] [-Q] [--sam|-s|-t]
AÇIKLAMA
[-M|--yalnızca eşlenmiş|-A|--tümü] [-o ] [-P|--eşli] [-N]
Not: Varsayılan olarak, kalite kontrollerini geçmediği için işaretlenen okumalar
atılan; NS -Q seçeneği, QC bayrağını yok saymak için kullanılabilir.
Kullan -N seçeneği ise /1 ve /2 ekleri eklenmelidir
SAM bayraklarına göre isimleri oku
Kullan -O kalite değerleri yazarken, varsa, OQ etiketini yoksayma seçeneği
onworks.net hizmetlerini kullanarak bam2fastx'i çevrimiçi kullanın
