Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen bp_chaos_plotp komutudur.
Program:
ADI
bp_chaos_plot - DNA ve RNA dizilerinden bir kaos planı
SİNOPSİS
bp_chaos_plot.pl -i/--input=GİRİŞ DOSYASI -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=ÇIKTI DOSYASI -g/--graphics=GRAFİK FORMATI
-w/--genişlik=GENİŞLİK -h/--yükseklik=YÜKSEKLİK
TANIM
Bu komut dosyaları, nükleotidi görselleştirmek için GD görüntü kitaplığını kullanarak görüntü dosyaları oluşturur.
kaos grafiğini kullanan diziler.
SEÇENEKLER
Geçerli grafik biçimleri şu anda gd, gd2, png, wbmp, jpeg ve gif'tir.
Görüntü dosyasının varsayılan boyutu 600x400'dür.
Sıra girişi, üç yöntemden herhangi biri kullanılarak sağlanabilir:
isimsiz argüman
bp_chaos_plot dosya adı
adlandırılmış argüman
bp_chaos_plot -i dosya adı
standart girdi
bp_chaos_plot < dosya adı
GERİ BİLDİRİM
Posta Listeler
Kullanıcı geri bildirimi, bu ve diğer Bioperl modüllerinin gelişiminin ayrılmaz bir parçasıdır. Göndermek
yorumlarınızı ve önerilerinizi tercihen Bioperl posta listesine. Senin katılımın
çok takdir edilmektedir.
[e-posta korumalı] - Genel Tartışma
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Posta listeleri hakkında
Raporlama Bugs
Hataları ve hatalarını takip etmemize yardımcı olması için hataları Bioperl hata izleme sistemine bildirin.
çözüm. Hata raporları web üzerinden gönderilebilir:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
YAZAR - Jason Stajiç
e-posta [e-posta korumalı]
TARİHİ
Bu kod, Ian Longden'ın kaos.c için EMBOSS C kodunu temel alır. Dahil olanlar
EMBOSS kodundan belgeler:
Kaos, bir kaos planı üretir. Orijinal uygulama ACEDB genomunun bir parçasıdır
veritabanı paketi, ** Richard Durbin (MRC LMB, İngiltere) tarafından yazılmıştır. [e-posta korumalı], ve
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Fransa) [e-posta korumalı]
onworks.net hizmetlerini kullanarak çevrimiçi olarak bp_chaos_plotp kullanın
