Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen bp_process_sgdp komutudur.
Program:
ADI
bp_process_sgd.pl - SGD ek açıklama düz dosyalarını aşağıdakilere uygun bir sürüme dönüştürün:
Genel Genom Tarayıcı
SİNOPSİS
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > maya.gff
AÇIKLAMA
Bu komut dosyası, şu konumda bulunan SGD dizisi ek açıklama düz dosyalarına masaj yapar:
ftp://genome-ftp.stanford.edu/pub/yeast/data_dump/feature/chromosomal_features.tab bir içine
GFF formatının genel genom tarayıcısı tarafından görüntülenmeye uygun versiyonu.
Bu betiği kullanmak için listelenen FTP sitesinden SGD chromosomal_features.tab dosyasını alın.
yukarıda ve aşağıdaki komutu çalıştırın:
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > maya.gff
Maya.gff dosyası daha sonra aşağıdakileri kullanarak bir Bio::DB::GFF veritabanına yüklenebilir:
komut:
% toplu_load_gff.pl -d maya.gff
Onworks.net hizmetlerini kullanarak bp_process_sgdp'yi çevrimiçi kullanın
