cmtk-convertx - Bulutta Çevrimiçi

Program:

ADI

convertx - Görüntü dosyası biçimleri ve veri türleri arasında dönüştürme.

SİNOPSİS

convertx [seçenekler] dosya içi dosya dışı

TANIM

Bu araç, görüntü dosyası biçimleri ve piksel veri türleri arasında dönüştürme yapar. Ayrıca başvurabilir
süreçte basit, genel amaçlı görüntü işlemleri. İsteğe bağlı sayıda işlem
tam olarak verilen sırayla uygulanacak olan komut satırında belirtilebilir.

SEÇENEKLER

Küresel Toolkit Opsiyonlar (bunlar vardır Paylaşılan by herşey CMTK aletler)
--yardım et
Standart çıktıya temel komut satırı seçeneklerinin listesini yazın.

--Herkese yardım et
Standart çıktıya temel ve gelişmiş komut satırı seçeneklerinin tam listesini yazın.

--wiki
MediaWiki işaretlemesinde standart çıktıya komut satırı seçeneklerinin listesini yazın.

--adam
Standart çıktıya 'nroff' işaretlemesinde man sayfası kaynağını yazın.

--versiyon
Araç takımı sürümünü standart çıktıya yazın.

--Eko
Geçerli komut satırını standart çıktıya yazın.

--ayrıntılı düzey
Ayrıntı düzeyini ayarlayın.

--ayrıntılı, -v
Ayrıntı düzeyini 1 artırın (kullanımdan kaldırıldı; geriye dönük uyumluluk için desteklenir).

--İş Parçacığı
Maksimum paralel iş parçacığı sayısını ayarlayın (POSIX iş parçacıkları ve OpenMP için).

Görüntü/Dönüşüm veritabanı
--db
Yeni oluşturulan ile güncellenmesi gereken görüntü/dönüşüm veritabanına giden yol
görüntü. [Varsayılan: YOK]

Giriş Resim Kontroller
--set-dolgu
Doldurma değerini ayarla: giriş görüntüsündeki bu değere sahip tüm pikseller yok sayılır
sonraki tüm işlemlerde.

--unset-dolgu
Ayarlanmamış dolgu değeri: sonraki tüm işlemler için tüm pikseller işlenir
değerlerine göre.

--etiketler
Görüntü değerlerinin ayrı etiketler olarak ele alınacağını belirtin. Bu sonuçlanacak
NIFTI formatındaki çıktı dosyalarında ayarlanacak uygun amaç kodunda.

--gri
Görüntü değerlerinin sürekli gri seviyeler olarak ele alınacağını belirtin. Bu irade
NIFTI biçiminden okunan dosyalarda amaç kodunu sıfırlayın.

Veri Tip Dönüştürme
--karakter
8 bit, işaretli tam sayı

--bayt
8 bit, işaretsiz tam sayı

--kısa boylu
16 bit, işaretli tam sayı

--kısa
16 bit, işaretsiz tam sayı

--int
32 bit işaretli tam sayı

--uint
32 bit işaretsiz tam sayı

--batmadan yüzmek
32 bit kayan nokta

--çift
64 bit kayan nokta

Özellik Eşlemeler
--map-değerleri
Piksel değerlerine eşleme işlevi uygulayın. Haritalama şu şekilde tanımlanır
'VAL0[,VAL1,...][:NEWVAL]', VAL0, VAL1, vb. değerlerini yeni NEWVAL değerine eşlemek için. Eğer
NEWVAL verilmez, değerler dolguya ayarlanır.

--harita-değerler-yalnızca
Piksel değerlerine eşleme işlevi uygulayın ve eşlenmemiş pikselleri dolgu ile değiştirin.
Bu tür birden çok eşleme kuralı, KURAL0+KURAL1[+...]; herşey
birleştirilmiş kurallar aynı anda uygulanacaktır. Eşleme şu şekilde tanımlanır:
'VAL0[,VAL1,...][:NEWVAL]', VAL0, VAL1, vb. değerlerini yeni NEWVAL değerine eşlemek için. Eğer
NEWVAL verilmez, değerler dolguya ayarlanır. Bu tür birden çok eşleme kuralı olabilir
KURAL0+KURAL1[+...] olarak birleştirilmiştir; tüm birleştirilmiş kurallar uygulanacaktır
eşzamanlı.

--değiştir-dolgu
Dolgulu piksel verilerini verilen değerle değiştirin.

--inf-nan'ı değiştir
Tüm sonsuz ve sayı olmayan pikselleri verilen değerle değiştirin.

Resim Lanetleme
--flip-x
X-yönü boyunca çevirin (ayna)

--flip-y
y yönünde çevirin (ayna)

--flip-z
Z-yönü boyunca çevirin (ayna)

Resim Maskeleme ve Eşik
--maske
İkili maske dosya adı: maskenin 0 olduğu tüm görüntü piksellerini ortadan kaldırın. Maskelenmiş pikseller
sıfıra AYARLANMAYACAKTIR, bunun yerine halihazırda ayarlanmış dolgu ile değiştirilecektir.
değer. Ayarı sıfıra zorlamak için '--mask' öncesinde '--set-padding 0' kullanın.

--maske-ters
Ters ikili maske dosya adı, maskenin 0 OLMADIĞI tüm görüntü piksellerini ortadan kaldırır. Bkz.
ayrıca yukarıdaki '--mask' altındaki dolgu ile ilgili notlar.

--eşik altı
Eşiğin altındaki tüm değerleri eşik değerine ayarlayın.

--thresh-üstü
Eşiğin üzerindeki tüm değerleri eşik değerine ayarlayın.

--harç altı-dolgusu
Eşiğin altındaki tüm değerleri dolgu değerine ayarlayın.

-- harman-üstü-dolgusu
Eşiğin üzerindeki tüm değerleri dolgu değerine ayarlayın.

--binarize-harman
Eşiğin altındaki tüm değerleri 0'a, tüm değerleri eşit veya 1'e ayarlayın.

--otsu-harma
Otsu yöntemiyle hesaplanan eşiği kullanarak görüntüyü 0/1'e ikili hale getirin. Argüman sayıdır
Eşik hesaplaması için histogram kutularının sayısı.

--otsu-thresh-nbins
için kullanıcı tanımlı sayıda histogram kutusuyla Otsu yöntemini kullanarak ikilileştirme
eşik hesaplama

--erik-histogram
'Yoğunluk histogramı budaması' ile eşik görüntüsü, yani verilen argüman n için
[histogram bölmeleri], en yüksek ve
en düşük vokseller eşiklenir.

--erik-histogram-yüksek
'--prune-histograms' gibi, ancak yalnızca yüksek yoğunlukları kaldırın.

--erik-histogram-düşük
'--prune-histograms' gibi, ancak yalnızca düşük yoğunlukları kaldırın.

yoğunluk Dönüşümler
--ölçekten menzile
Bayt'a dönüştürmeden önce görüntü yoğunluklarını 'den:'e', örneğin '0:255' aralığına ölçeklendirin
verileri.

--histogram-dengeleme
Histogram eşitlemeyi uygulayın.

--histogram-dengeleme-nbins
Histogram eşitlemeyi şununla uygula: bidon sayısı.

--match-histogramları
Argüman olarak sağlanan görüntüdeki dağılımla eşleşmesi için yoğunlukları dönüştürün
bu komut için.

--match-mean-sdev
Yoğunlukları, ortalama ve standart yoğunluk dağılımına uyacak şekilde ölçeklendirin.
Bu komut için argüman olarak sağlanan görüntü.

Morfolojik Operasyon
--geri almak
İkili bir maskeyi geri alın, yani ön plan ve arka planı değiştirin.

--aşındırmak
Morfolojik erozyon operatörü (piksel olarak)

--genişletmek
Morfolojik genişleme operatörü (piksel olarak)

--erode-mesafe
Morfolojik erozyon operatörü (mesafeye göre). Genellikle anizotropik veriler için tercih edilir.

--erode-mesafe-multilabel
Çok etiketli haritalar için morfolojik erozyon operatörü (mesafeye göre). Sonuç olacak
dizinine bağlı olarak bayt, imzasız kısa veya imzasız int verileri
girişte kullanılan en büyük etiket.

--genişlet-mesafe
Morfolojik genişleme operatörü (mesafeye göre). Genellikle anizotropik için tercih edilir
verileri.

--bağlı-bileşenler
Bileşen boyutunu küçülterek numaralandırılmış bölgelerle bağlantılı bileşenler haritası oluşturun

--sınır-haritası
Sınır haritası oluştur

--çoklu-sınır-haritası
Çok değerli sınır haritası oluşturun

--mesafe haritası
İşaretsiz Öklid uzaklık haritasını hesaplayın. Giriş görüntüsü ikili maske olarak yorumlanır.

--imzalı-mesafe haritası
Hesaplama imzalı (iç=negatif, dış=pozitif) Öklid uzaklık haritası

filtre Operasyon
--ortanca-filtre
Medyan filtre. Bu işlem, parametre olarak filtre yarıçapını piksel olarak alır. A
tek tamsayı, her üç boyutta da çekirdek yarıçapını tanımlar. Üç virgül
ayrılmış tamsayılar, üç boyut için ayrı yarıçaplar tanımlar.

--ortalama-filtre
Bölgesel ortalama filtre. Bu işlem, filtre yarıçapını piksel olarak alır.
parametre. Tek bir tamsayı, her üç boyutta da çekirdek yarıçapını tanımlar. Üç
virgülle ayrılmış tamsayılar, üç boyut için ayrı yarıçaplar tanımlar.

--hızlı-ortalama-filtre
Bölgesel ortalama filtresi (hızlı, doğrusal zaman uygulaması). Bu işlem,
parametre olarak piksel cinsinden filtre yarıçapı. Tek bir tamsayı çekirdek yarıçapını tanımlar
her üç boyutta. Virgülle ayrılmış üç tam sayı, aşağıdakiler için ayrı yarıçaplar tanımlar.
üç boyut.

--varyans-filtre
Bölgesel fark filtresi. Bu işlem, filtre yarıçapını piksel olarak alır.
parametre. Tek bir tamsayı, her üç boyutta da çekirdek yarıçapını tanımlar. Üç
virgülle ayrılmış tamsayılar, üç boyut için ayrı yarıçaplar tanımlar.

--hızlı-varyans-filtre
Hızlı (doğrusal zamanlı) bölgesel varyans filtresi. Bu işlem filtre yarıçapını alır
parametre olarak piksel cinsinden. Tek bir tamsayı, her üçünde de çekirdek yarıçapını tanımlar.
boyutlar. Virgülle ayrılmış üç tam sayı, üç sayı için ayrı yarıçaplar tanımlar.
boyutları.

--üçüncü an filtresi
Bölgesel üçüncü an filtresi. Bu işlem, filtre yarıçapını piksel olarak alır.
parametre. Tek bir tamsayı, her üç boyutta da çekirdek yarıçapını tanımlar. Üç
virgülle ayrılmış tamsayılar, üç boyut için ayrı yarıçaplar tanımlar.

--standart-sapma-filtresi
Bölgesel standart sapma filtresi. Bu işlem filtre yarıçapını piksel olarak alır
parametre olarak. Tek bir tamsayı, her üç boyutta da çekirdek yarıçapını tanımlar.
Virgülle ayrılmış üç tam sayı, üç boyut için ayrı yarıçaplar tanımlar.

--pürüzsüzlük-filtresi
Bölgesel 'pürüzsüzlük' filtresi. Bu işlem, filtre yarıçapını piksel olarak alır.
parametre. Tek bir tamsayı, her üç boyutta da çekirdek yarıçapını tanımlar. Üç
virgülle ayrılmış tamsayılar, üç boyut için ayrı yarıçaplar tanımlar.

--gauss-filtre-sigma
Gauss çekirdeği ile filtre görüntüsü. Bu işlem tek bir gerçek değerli
sigma çekirdek katsayısını dünya birimlerinde [örn. mm] olarak belirten parametre
parametre.

--gauss-filtre-fwhm
Gauss çekirdeği ile filtre görüntüsü. Bu işlem tek bir gerçek değerli
çekirdek tam genişliğini dünya birimleri cinsinden maksimum yarı yarıya belirten parametre
[örneğin, mm].

--laplace-filtre
Kenar geliştirici Laplacian çekirdeği ile filtre görüntüsü.

Grid Operasyon
--downsample-seçim
Eksen başına faktörleri 'Fx, Fy, Fz' kullanarak veya tekli kullanarak piksel seçimine göre görüntüyü alt örnekle
faktör 'Fxyz'

--downörnek-ortalama
Eksen başına faktörleri 'Fx, Fy, Fz' kullanarak veya tekli kullanarak ortalamayı alarak görüntüyü alt örnekleyin
faktör 'Fxyz'

--yeniden örnek
Görüntünün görüş alanını korurken görüntüyü yakın izotropik piksellere yeniden örnekleyin.
Bir argüman alır, dünya birimlerinde hedef çözünürlük [örneğin, mm]

--yeniden örnek-tam
Görüntüyü, verilen çözünürlükteki tam olarak izotropik piksellerle eşleştirirken yeniden örnekleyin.
mümkün olduğunca yakından görüntü görüş alanı. Bir argüman alır, hedef çözünürlük
dünya birimlerinde [örneğin, mm]

--dizine göre kırpma
Görüntüyü, şu şekilde verilen altı ızgara indeksi koordinatı kümesiyle belirtilen bir bölgeye kırpın.
comma-separated integers x0,y0,z0,x1,y1,z1

--kırpma-eşik
Görüntüyü belirli bir eşik aracılığıyla belirlenen bölgeye kırpın. Ortaya çıkan görüntü
verilen parametreden daha büyük tüm pikselleri içerir.

--eşiğe göre-yazma-bölgesi
Görüntüyü belirli bir eşik aracılığıyla belirlenen bölgeye kırpın ve kırpma bölgesini
standart çıktı.

--eşiğe göre-yazma-xform
Görüntüyü belirli bir eşik aracılığıyla belirlenen bölgeye kırpın ve kırpmayı yazın
standart çıktıya dönüştürme.

YAZARLAR

Torsten Rohlfing, Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff ve Yaroslav Halchenko

onworks.net hizmetlerini kullanarak cmtk-convertx'i çevrimiçi kullanın