Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut kapsama Sayısıdır.
Program:
ADI
kapsama Sayısı - haritalanmış okumaların kapsamının tamamının her bir yerinde sayılması
referans genom
TANIM
kapsamaCount Sürüm 1.5.0-p1
Bu program, haritadaki her bir konumdaki haritalanmış okumaların kapsamını hesaplar.
referans genomu. birleştirerek her kromozom için bir ikili dosya oluşturur.
4 baytlık tamsayı sayıları olarak kapsama seviyeleri.
kullanım
kapsamaCount [seçenekler] -i -o
Gerekli argümanlar:
-i
SAM veya BAM formatında girdi dosyasının adı.
-o
Çıktı dosyalarının öneki. Her çıktı dosyası, Dört baytlık tamsayı sayıları içerir
İsteğe bağlı argümanlar:
--maxMOp Bir CIGAR dizisinde izin verilen maksimum 'M' işlemi sayısı.
varsayılan olarak 10. Hem 'X' hem de '=', 'M' olarak kabul edilir ve bitişik 'M' işlemleri
CIGAR dizisinde birleştirildi.
kapsamaCount Sürüm 1.5.0-p1
Bu program, haritadaki her bir konumdaki haritalanmış okumaların kapsamını hesaplar.
referans genomu. birleştirerek her kromozom için bir ikili dosya oluşturur.
4 baytlık tamsayı sayıları olarak kapsama seviyeleri.
kullanım
kapsamaCount [seçenekler] -i -o
Gerekli argümanlar:
-i
SAM veya BAM formatında girdi dosyasının adı.
-o
Çıktı dosyalarının öneki. Her çıktı dosyası, Dört baytlık tamsayı sayıları içerir
İsteğe bağlı argümanlar:
--maxMOp Bir CIGAR dizisinde izin verilen maksimum 'M' işlemi sayısı.
varsayılan olarak 10. Hem 'X' hem de '=', 'M' olarak kabul edilir ve bitişik 'M' işlemleri
CIGAR dizisinde birleştirildi.
onworks.net hizmetlerini kullanarak kapsama Sayısını çevrimiçi kullanın
