Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen fastaq-to_fasta komutudur.
Program:
ADI
fastaq_to_fasta - Çeşitli girdi biçimlerini güzel biçimlendirilmiş FASTA biçimine dönüştürür
TANIM
kullanım: fastaq_to_fasta [seçenekler]
Çeşitli giriş biçimlerini güzel biçimlendirilmiş FASTA biçimine dönüştürür
konumsal argümanlar:
infile Giriş dosyasının adı. FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip'ten herhangi biri olabilir
dış dosya
Çıktı dosyasının adı
isteğe bağlı argümanlar:
-h, --yardım et
bu yardım mesajını göster ve çık
-l LINE_LENGTH, --line_uzunluk LINE_LENGTH
Çıktı dosyasının her sıra satırındaki baz sayısı. Hayır için sıfıra ayarla
dizilerdeki satır sonları [60]
-s, --strip_after_whitespace
Her sıra adındaki ilk boşluktan sonraki her şeyi kaldırın
-u, --check_benzersiz
Çıkış dizisi adlarından herhangi biri benzersiz değilse ölür
onworks.net hizmetlerini kullanarak fastaq-to_fasta'yı çevrimiçi kullanın