Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut sarımsaktır.
Program:
ADI
sarımsak - moleküler görselleştirme programı
SİNOPSİS
sarımsak [gerçek sarımsak seçenekleri] [X11 seçenekleri] [Dosya]
TANIM
Bu kılavuz sayfası kısaca belgeler sarımsak, ücretsiz bir moleküler görselleştirme programı.
HTML formatında kapsamlı belgeler ve kaynaklar sarımsak evinde bulunabilir,
<URL:http://garlic.mefos.hr/garlic/>. Fiziksel konum: Tıp Fakültesi, Üniversite
Osijek, Hırvatistan, Avrupa. Bir dizi GNU/Linux dağıtımı için önceden derlenmiş paketler
mevcut. Bunlara Debian, SuSE, Mandriva, Linspire ve bir dizi diğer dahildir.
dağıtımlar. HTML belgeleri yerel kullanım için indirilebilir ve paketinden çıkarılabilir (önerilir
kullanım). Burada programın çok kısa bir açıklamasını ve komut listesini bulabilirsiniz.
satır seçenekleri.
sarımsak orijinal olarak araştırılması için yazılmış bir moleküler görselleştirme programıdır.
zar proteinleri. Artık tüm proteinleri görselleştirmek ve basit bir şekilde düzenlemek için kullanılabilir ve
moleküller. Bu sürüm, PDB biçimi sürüm 2.1'i tanır; kaynak dosyaya bakın pdb_atom.c
Bu biçimle ilgili ayrıntılar için.
SEÇENEKLER
Komut satırı seçenekleri iki gruba ayrılabilir: gerçek (özel) sarımsak seçenekleri ve X11
seçenekleri. Seçenekler herhangi bir sırayla verilebilir. Tüm seçenekler ve sabit kodlanmış varsayılan değerler
aşağıdaki tabloda listelenmiştir. Her parametre için komut satırı aracılığıyla tanımlanan değer
varsa kullanılır. Değilse, içinde tanımlanan değer .sarımsak dosya kullanılır. Eğer .sarımsak
dosya mevcut değil veya bu dosyada karşılık gelen bir giriş yok, sabit kodlanmış
varsayılan değer kullanılır. Örnek .sarımsak orijinal pakette bulunan dosya şunları içerir:
değerler sabit kodlanmış varsayılanlara eşittir.
sarımsak seçenekleri:
-H, --yardım et
Yardımı yazdırın ve çıkın.
-içinde, --versiyon
Sürümü yazdırın ve çıkın.
-R, --Kayıt ol
Sarımsak kaydedin: yazara sitenizde sarımsak kurulu olduğunu ve birisinin
bu programı kullanacak. Kaydolarak, yazarı teşvik ediyorsunuz
Sarımsak geliştirmeye devam edin. Ayrıca, yazarın aşağıdakiler için destek sağlamasına yardımcı olabilirsiniz:
Daha fazla gelişme. Bu seçenek, yalnızca şunu içeren kısa bir e-posta mesajı gönderir:
e-posta mesajı başlığı ve 'Merhaba!'[e-posta korumalı]>. Lütfen
Bu programı kullanacaksanız sarımsak -r yürütün. bağlı değilseniz
İnternet, başka bir sistemden kısa bir mesaj göndermeyi düşünün.
-meraklı Koordinat sistemi simgesini gizleyin (sol üst köşe).
-kontrol yok
Kontrol penceresini gizleyin (sağ üst köşe).
-müzik seti
Stereo görüntüyü göster.
-döşeme kip
Varsayılan döşeme modu. Mevcut döşeme modları şunlardır: kapalı, düzlemsel (varsayılan), küre,
yarım küre, silindir ve yarım silindir.
-solma kip
Varsayılan renk solması modu. Kullanılabilir modlar: kapalı, düzlemsel (varsayılan), küre,
yarım küre, silindir ve yarım silindir.
-gibi numara
Varsayılan atom çizim stili (sabit kodlanmış varsayılan: 2).
-bs numara
Varsayılan tahvil çizim stili (sabit kodlanmış varsayılan: 2).
-fs numara
Varsayılan renk solması yüzey sayısı. Paralel düzlemler, eş merkezli küreler veya
konsantrik silindirler, sönümleme yüzeyleri olarak kullanılabilir. Üç RGB üçlüsü
her yüzeye atanır. Yüzeyler eşit aralıklarla yerleştirilmiştir; en az bir ve en fazla
sekiz tanımlanmalıdır. En az üç renk (sol, orta ve sağ)
her görünür atoma atanır. Bu üç renk, bir
en yakın solma yüzeyine/yüzeylerine göre verilen atom ve atanan renkler üzerinde
bu yüzeyler. Renkler doğrusal ağırlıklandırma kullanılarak birleştirilir.
-lc renk
i-inci yüzeyde sol renk; ben sıfır ile yedi arasındayım. renk dizisi
X11R5 ile uyumlu olmalıdır. Örneğin mavi, mavi olarak veya şu şekilde tanımlanabilir:
RGB:0000/0000/FFFF vb. Örneğin -lc4 RGB:BBBB/8888/4444 sol rengi tanımlar
indeksi dörde eşit olan yüzeyde.
-mc renk
i-inci yüzeyde orta renk.
-rc renk
i-inci yüzeyde doğru renk.
-bilgisayar, --print-config
Yapılandırma verilerini yazdırın ve çıkın.
-pcn İmleç adlarını stdout'a yazdırın ve çıkın.
log kayıt dosyası
Günlük dosyasına komutlar ve mesajlar yazın. Dosya mevcut durumda oluşturulacak
çalışma dizini. Bu mümkün değilse, kullanıcıların evinde günlük dosyası oluşturulacaktır.
dizin.
X11 seçenek:
-Görüntüle ekran adı
İletişim kurulacak X sunucusu.
-geometri geom
Pencere geometrisi (varsayılan: neredeyse tüm ekran).
-bg renk
Ana pencere arka plan rengi (varsayılan siyahtır).
-fg renk
Ana pencere ön plan rengi (varsayılan: beyaz).
-fn Yazı tipi adı
Metin yazı tipi; (varsayılan 10x20'dir).
-tbg renk
Metin arka plan rengi (varsayılan siyahtır).
-tfg renk
Metin rengi (varsayılan beyazdır).
-imleç imleç adı
İmleç adı; görmek /usr/include/X11/cursorfont.h isimler için; XC_ önekini kaldırın.
onworks.net hizmetlerini kullanarak çevrimiçi sarımsak kullanın
