Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen gt-chseqids komutudur.
Program:
ADI
gt-chseqids - Bir eşleme dosyasında verilen eşlemeye göre sıra kimliklerini değiştirin.
SİNOPSİS
gt chseqids [seçenek ...] mapping_file [GFF3_file]
TANIM
-çeşit [evet|hayır]
Dizi kimliklerini değiştirdikten sonra GFF3 özelliklerini sıralayın (bellek tüketimi
giriş dosyası boyutuyla orantılı) (varsayılan: hayır)
-v [evet|hayır]
ayrıntılı ol (varsayılan: hayır)
-o [Dosya]
çıktıyı belirtilen dosyaya yönlendir (varsayılan: tanımsız)
-gzip [evet|hayır]
gzip sıkıştırılmış çıktı dosyası yaz (varsayılan: hayır)
-bzip2 [evet|hayır]
bzip2 sıkıştırılmış çıktı dosyası yaz (varsayılan: hayır)
-güç [evet|hayır]
çıktı dosyasına yazmaya zorla (varsayılan: hayır)
-Yardım
yardımı göster ve çık
-version
sürüm bilgilerini göster ve çık
mapping_file için dosya formatı:
Sağlanan eşleme dosyası, "chseqids" adlı bir eşleme tablosunu tanımlar. haritasını çıkarıyor
GFF3_file'de diğer adlara verilen sıra-bölge girişleri. olarak tanımlanabilir
aşağıdaki gibidir:
chseqids = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
Bu örnek kullanıldığında, tüm "chr1" dizi kimlikleri "seq1" olarak değiştirilecek ve tümü
dizi kimlikleri "chr2" ila "seq2".
RAPORLAMA BÖCEK
Hataları şuraya bildir:[e-posta korumalı]>.
onworks.net hizmetlerini kullanarak gt-chseqids'i çevrimiçi kullanın
