Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut maskesidir.
Program:
ADI
maskfeat - Maskelenmiş özelliklere sahip bir dizi yaz
SİNOPSİS
maske başarısı -sıra devamı [tipi dizi] [-daha düşük geçiş] -maske karakteri dizi -outseq takip
maske başarısı -Yardım
TANIM
maske başarısı EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık
Yazılım Paketi”). "Düzenle,Özellik tabloları" komut grup(lar)ının bir parçasıdır.
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-sıra devamı
Ek Bölüm
tipi dizi
Varsayılan olarak, özellik tablosundaki 'tekrar' ile başlayan herhangi bir özellik maskelenir.
Bunu, maskelemek istediğiniz herhangi bir özellik türü olarak ayarlayabilirsiniz. Görmek
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ EMBL özellik türlerinin listesi için bkz.
Swissprot kullanım kılavuzunun Ek A http://www.expasy.org/sprot/userman.html
Swissprot özellik türlerinin listesi için. Tür, '*' kullanılarak joker karaktere dönüştürülebilir. Eğer
birden fazla türü maskelemek istiyorsanız, adlarını boşluk veya virgülle ayırın, örneğin:
*UTR tekrarı* Varsayılan değer: tekrar*
-daha düşük geçiş
Bölge, dizi karakterlerini küçük harfe dönüştürerek 'maskelenebilir', bazıları
EMBOSS olmayan programlar, örneğin fasta, bunu maskelenmiş bir bölge olarak yorumlayabilir. sıra
kasa değişikliği dışında değişmez. Tüm sıranın olduğundan emin olmak isteyebilirsiniz.
kullanarak belirtilen bölgeleri küçük harfle maskelemeden önce büyük harftir.
'-akşam yemeği' bayrağı. Varsayılan değer: N
-maske karakteri dizi
Maskeleme sırasında kullanılacak karakter. Varsayılan, protein dizileri için 'X', nükleik için 'N'dir.
diziler. Maske karakteri BOŞLUK karakteri veya boş karakter olarak ayarlanmışsa,
daha sonra dizi, tıpkı aşağıdaki gibi küçük harfe dönüştürülerek 'maskelenir'
'-küçük harf' bayrağı. Varsayılan değer: @($(acdprotein)?X:N)
Çıktı Bölüm
-outseq takip
onworks.net hizmetlerini kullanarak maskfeate'i çevrimiçi kullanın
