mia-3dmotioncompica-nonrigid - Bulutta Çevrimiçi

Program:

ADI

mia-3dmotioncompica-nonrigid - Bir dizi 3B görüntünün doğrusal olmayan kaydı.

SİNOPSİS

mia-3dmotioncompica-sert olmayan -i -o [seçenekler]

TANIM

mia-3dmotioncompica-sert olmayan Bu program, hareketin 3 boyutlu bir versiyonunu uygular.
Wollny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ'de açıklanan tazminat algoritması,
Tarafından elde edilen Miyokardiyal Perfüzyon Verilerinin Serbest Solunumun Otomatik Hareket Telafisi
Bağımsız Bileşen Analizi kullanılarak", Tıbbi Görüntü Analizi, 2012,
DOI:10.1016/j.media.2012.02.004.

SEÇENEKLER

Dosya-IO
-i --in-file=(girdi, gerekli); io
Ardışık olarak numaralandırılmış dosyalanmış giriş görüntüleri (nameXXXX.ext) Desteklenenler için
dosya türleri bkz. EKLENTİLER:3dimage/io

-o --out-file=(çıktı, gerekli); io
çıktı görüntü adı (tanımlamak için bir %04d içeren C biçimi dizesi olarak)
dosya numaralandırma) Desteklenen dosya türleri için bkz. EKLENTİLER:3dimage/io

--kaydet-refs=
referans görüntüleri kaydedin, verilen dize dosya adı tabanı olarak kullanılır,
sayı deseni giriş görüntülerini takip eder ve çıktı biçimi her zaman
"manzara"

--kaydet-kayıtlar=
ara kayıtlı görüntüleri kaydedin, verilen dize dosya adı olarak kullanılır
taban, sayı deseni giriş görüntülerini takip eder ve çıktı formatı
her zaman "görüntü"

--save-katsayıları=
karıştırma matrisini bir metin dosyasına kaydet

--save-özellikleri=
özellik resimlerini PNG olarak kaydet

Destek & Bilgi
-V --verbose=uyarı
çıktının ayrıntı düzeyi, verilen düzeyde ve daha yüksek önceliklerde yazdırılan mesajlar.
En düşük seviyeden başlayan desteklenen öncelikler şunlardır:
bilgi - Düşük seviyeli mesajlar
iz - İşlev çağrısı izleme
başarısız - Test hatalarını bildirin
uyarı - Uyarılar
hata - Hataları bildir
ayıklamak - Hata ayıklama çıktısı
mesaj - Normal mesajlar
ölümcül - Yalnızca önemli hataları bildirin

--telif hakkı
telif hakkı bilgilerini yazdır

-h -- yardım
bu yardımı yazdır

-? --kullanım
kısa bir yardım yazdır

--versiyon
sürüm numarasını yazdırın ve çıkın

ICA
-C --bileşenler=0
ICA bileşenleri 0 = otomatik tahminICA bileşenleri 0 = otomatik
tahmin

--no-normalleştirme
IC'leri normalleştirmeyin

--yok-yolsuz
ortalamayı karıştırma eğrilerinden çıkarmayın

-k --atla=0
serinin başındaki resimleri atlayın, örneğin diğer resimlerde olduğu gibi
modalitelerserilerin başındaki görüntüleri atlayın, örn.
diğer modalitelerden

-m --max-ica-iter=400
ICA'daki maksimum yineleme sayısı ICA'daki maksimum yineleme sayısı

İşlemde
--iş parçacıkları=-1
İşlem için kullanılacak maksimum iş parçacığı sayısı, Bu sayı daha düşük olmalıdır
veya makinedeki mantıksal işlemci çekirdeklerinin sayısına eşittir. (-1:
otomatik tahmin).İşleme için kullanılacak maksimum iş parçacığı sayısı,Bu
sayısı, mantıksal işlemci çekirdeklerinin sayısına eşit veya daha düşük olmalıdır.
makine. (-1: otomatik tahmin).

kayıtlar
-O --optimizer=gsl:opt=gd,adım=0.1
En aza indirmek için kullanılan optimize edici

-a --start-c-hızı=32
dikenlerde katsayı oranını başlat, --c-rate-divider ile bölünür
dikenlerdeki her geçiş katsayı oranı, --c-rate-divider ile bölünür
her geçişte

--c-oran bölücü=4
her geçiş için yeterli hız bölücü Her geçiş için yeterli hız bölücü

-d --start-divcurl=20
divcurl ağırlığını başlat, her geçişte --divcurl-divider ile bölünür
divcurl ağırlığı, her geçişte --divcurl-divider ile bölünür

--divcurl-bölücü=4
her yeni passdivcurl ile ağırlık ölçekleme her yeni ile divcurl ağırlık ölçeklendirme
yeni geçiş

-w --imagecost=image:ağırlık=1,maliyet=ssd,
görüntü maliyeti

-l --mg-seviyeleri=3
çoklu çözünürlük seviyeleriçoklu çözünürlük seviyeleri

-P --geçer=3
kayıt pasolarıkayıt pasoları

EKLENTİLER: 3 boyutlu resim/io

çözümlemek 7.5 görüntüsünü analiz et

Tanınan dosya uzantıları: .HDR, .hdr

Desteklenen eleman türleri:
imzasız 8 bit, imzalı 16 bit, imzalı 32 bit, kayan nokta 32 bit,
kayan nokta 64 bit

veri havuzu Dahili veri havuzuna ve havuzdan sanal IO

Tanınan dosya uzantıları: .@

Dicom 3D olarak Dicom görüntü serisi

Tanınan dosya uzantıları: .DCM, .dcm

Desteklenen eleman türleri:
imzalı 16 bit, imzasız 16 bit

hdf5 HDF5 3D görüntü GÇ

Tanınan dosya uzantıları: .H5, .h5

Desteklenen eleman türleri:
ikili veri, işaretli 8 bit, işaretsiz 8 bit, işaretli 16 bit, işaretsiz 16 bit,
imzalı 32 bit, imzasız 32 bit, imzalı 64 bit, imzasız 64 bit, yüzer
nokta 32 bit, kayan nokta 64 bit

Hindistan INRIA resmi

Tanınan dosya uzantıları: .INR, .inr

Desteklenen eleman türleri:
imzalı 8 bit, imzasız 8 bit, imzalı 16 bit, imzasız 16 bit, imzalı 32
bit, işaretsiz 32 bit, kayan nokta 32 bit, kayan nokta 64 bit

mhd VTK uygulamasını kullanarak MetaIO 3D görüntü IO (deneysel).

Tanınan dosya uzantıları: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Desteklenen eleman türleri:
imzalı 8 bit, imzasız 8 bit, imzalı 16 bit, imzasız 16 bit, imzalı 32
bit, işaretsiz 32 bit, kayan nokta 32 bit, kayan nokta 64 bit

güzel NIFTI-1 3D görüntü GÇ

Tanınan dosya uzantıları: .NII, .nii

Desteklenen eleman türleri:
imzalı 8 bit, imzasız 8 bit, imzalı 16 bit, imzasız 16 bit, imzalı 32
bit, imzasız 32 bit, imzalı 64 bit, imzasız 64 bit, kayan nokta 32
bit, kayan nokta 64 bit

VFF VFF Sun raster formatı

Tanınan dosya uzantıları: .VFF, .vff

Desteklenen eleman türleri:
imzasız 8 bit, imzalı 16 bit

manzara 3D görünüm

Tanınan dosya uzantıları: .V, .VISTA, .v, .vista

Desteklenen eleman türleri:
ikili veri, işaretli 8 bit, işaretsiz 8 bit, işaretli 16 bit, işaretsiz 16 bit,
imzalı 32 bit, imzasız 32 bit, kayan nokta 32 bit, kayan nokta 64
bit

vti 3D görüntü VTK-XML giriş ve çıkış (deneysel).

Tanınan dosya uzantıları: .VTI, .vti

Desteklenen eleman türleri:
imzalı 8 bit, imzasız 8 bit, imzalı 16 bit, imzasız 16 bit, imzalı 32
bit, işaretsiz 32 bit, kayan nokta 32 bit, kayan nokta 64 bit

vtk 3D VTK görüntü eski giriş ve çıkış (deneysel).

Tanınan dosya uzantıları: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Desteklenen eleman türleri:
ikili veri, işaretli 8 bit, işaretsiz 8 bit, işaretli 16 bit, işaretsiz 16 bit,
imzalı 32 bit, imzasız 32 bit, kayan nokta 32 bit, kayan nokta 64
bit

ÖRNEK

4 sınıf ICA kullanarak imagesXXXX.v görüntülerinde verilen perfüzyon serisini kaydedin
tahmin. Başlangıçta iki resim atlayın, en fazla 4 kayıt iş parçacığı kullanın, bir nlopt
tabanlı optimize edici ve diğer durumlarda varsayılan parametreleri kullanır. Sonucu şurada saklayın:
kayıtlıXXXX.v

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i images0000.v -o kayıtlı%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

YAZAR(lar)

Gert Wollny

TELİF HAKKI

Bu yazılımın Telif Hakkı (c) 1999‐2015 Leipzig, Almanya ve Madrid, İspanya'ya aittir. Gelir
KESİNLİKLE HİÇBİR GARANTİ YOKTUR ve GNU koşulları altında yeniden dağıtabilirsiniz.
GENEL KAMU LİSANSI Sürüm 3 (veya üstü). Daha fazla bilgi için programı şununla çalıştırın:
'--telif hakkı' seçeneği.

onworks.net hizmetlerini kullanarak mia-3dmotioncompica-nonrigid çevrimiçi kullanın