Bu, en son sürümü dew_RC2.tar.bz2 olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalıştırılmak üzere Web'de Digital Expression adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için Web'de Digital Expression adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
Linux'ta çevrimiçi çalıştırmak için Web'de Dijital İfade
Ad
AÇIKLAMA
DEW, kullanıcıların RNA-Seq verilerini keşfetmesine olanak tanıyan bir platformdur. Web tabanlı bir Grafik Kullanıcı Arayüzü dahildir.Analiz şu şekilde ilerler: boşluklu hizalamalar gerçekleştirilir ve uzunluk, PCR ve parça yanlılığı için düzeltilir, böylece Milyon Okuma Başına (etkili) Kilobaz (FPKM) ve daha basit Okuma Başına Milyon Okuma (Kb Başına Okuma) tahmin edilir ( RPKM). Çoklu izoformlarla sağlandığında ve 'bağlamsal' modda, düzeltmeler bir beklenti maksimizasyon algoritması içerir, etkili ifade profillerini tahmin eder ve düzeltilmiş bir hizalama üretilir. Kullanıcının sağladığı her gen için DEW, kapsama tanımlayıcı istatistiklerini (RPKM, FKMP ve toplam, ortalama ve medyan düzeltilmiş sayılar), ifade profillerini (R/FPKM olarak normalize edilmiş ve kat değişiminin kırpılmış ortalaması) hesaplar. DEW, kullanıcıların etkileşimli grafikler sağlayarak verileri keşfetmesine olanak tanır.
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Web tabanlı
Programlama dili
Perl, JavaScript, S/R
Veritabanı Ortamı
SQLite
Bu, https://sourceforge.net/projects/dew/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
