Bu, en son sürümü hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalıştırılacak Hamstr adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için Hamstr adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
Hamstr, Linux'ta çevrimiçi çalışacak
Ad
AÇIKLAMA
HaMStR şuraya taşındı: https://github.com/bionf/hamstr şimdi HaMStR-OneSeq paketinin bir parçası.HaMStR, EST veya protein dizisi verilerinde yönlendirilmiş bir ortolog araması için profil gizli Markov modeli tabanlı bir araçtır. Program, ortolog dizilerin (çekirdek ortologlar) önceden tanımlanmış bir çekirdek grubunu ve bir arama taksonundan girdi olarak bir dizi diziyi alır. HaMStR daha sonra iki aşamalı bir stratejide pHMM tabanlı bir aramayı ve BLAST aracılığıyla bir ters aramayı birleştirerek çekirdek ortolog grubunu arama taksonundan yeni dizilerle genişletmek için birleştirir.
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
Perl
Bu, https://sourceforge.net/projects/hamstr/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
