Bu, en son sürümü htdpinstaller.exe olarak indirilebilen Yüksek Verimli Tablo Veri İşlemcisi adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile Yüksek Verimli Tablo Veri İşlemcisi adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
Yüksek Verimli Tablo Veri İşlemcisi
AÇIKLAMA
YÜKSEK GEÇİŞLİ TABULAR VERİ İŞLEMCİ (HTDP), örneğin büyük ölçüde paralel sıralama veya mikrodiziler gibi yüksek verimli teknolojilerden kaynaklanan büyük metin dosyalarında veri araştırma ve azaltma görevlerini kolaylaştırmayı amaçlayan Java uygulamasıdır. Yazılım, mikrodizi ve derin paralel sıralama verileri için optimize edilmiştir, ancak herhangi bir karakterle sınırlandırılmış tablo veri setini kabul edebilir. HTDP ayrıca Varyant Çağrı Formatı (VCF) dosyalarını ver. 4.0, 4.1 ve 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP, hızlı filtreleme işlevi sağlar ve tek veya çoklu giriş dosyalarından oluşan verileri işleyebilir.
Alıntı: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Yüksek Verimli Tablo Veri İşlemcisi – Büyük veri kümelerini işlemek için platformdan bağımsız grafik aracı. PLoS BİR 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Özellikler
- karakterle sınırlandırılmış herhangi bir sütun verisi üzerinde çalışır (örneğin BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- tablo veri dosyalarını dikey ve yatay olarak birleştirme
- genom konumu veya ortak sütun(lar) kullanarak herhangi bir tablo veri dosyasını birleştirin
- sınırsız filtreleme ve veri azaltma yetenekleri
- biçim ve içerik açısından farklı dosyalar aynı anda analiz edilebilir
Programlama dili
Java
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/htdp/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.