Bu, en son sürümü HMCan.tar.gz olarak indirilebilen HMCan adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
HMCan adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
HMCan
Ad
TANIM
HMCan, kanser ChIP-seq verilerinde histon modifikasyonunu tespit etmek için geliştirilmiş Gizli Markov Modeli tabanlı bir araçtır. Verilere üç düzeltme adımı uygular: kopya numarası düzeltmesi, GC sapma düzeltmesi ve gürültü seviyesi düzeltmesi.
HMCan'ı çalıştırmak için ChIP-seq hedef hizalama dosyasına ve kontrol hizalama dosyasına ihtiyaç vardır. Bazı konfigürasyonlar da gereklidir, daha fazla bilgi için lütfen README dosyasını kontrol edin.
Yazar: Haitham Ashoor
İletişim: Valentina Boeva Enstitüsü Curie
Haitham Ashoor Kral Abdullah Bilim ve Teknoloji Üniversitesi.
Programlama dili
C + +
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/hmcan/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
