Bu, en son sürümü Data-Maragap.rar olarak indirilebilen MARAGAP adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
MARAGAP adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
MARAGAP
Ad
AÇIKLAMA
Bu makale, referans destekli bir genom derleme boru hattı olan 'MARAGAP'ı sunar. MARAGAP, montaj için en uygun referans sırasını belirlemek için Minimum Tanım Uzunluğu ilkesini kullanır. Optimal referans dizisi, hedef genomdaki inversiyonları, eklemeleri, silmeleri ve SNP'leri çıkarmak için bir şablon olarak kullanılır. MARAGAP, inversiyonları ve silmeleri tespit etmek ve düzeltmek için algoritmik bir yaklaşım, eklemeleri çıkarmak için De-Bruijn grafiğine dayalı bir yaklaşım, bu eklemelerin konumlarını tahmin etmek için bir afin eşleşme afin-boşluk yerel hizalama aracı ve SNP'ler için bir Bayes tahmin çerçevesi kullanır.Bu, https://sourceforge.net/projects/refasp/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
