Bu, en son sürümü WindowsRelease.zip olarak indirilebilen Molecular Dynamics Studio adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
Molecular Dynamics Studio adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
Moleküler Dinamik Stüdyosu
TANIM
Bu, moleküler dinamik hücrelerini kolayca oluşturmak amacıyla NanoEngineer-1, PACKMOL ve MSI2LMP'yi entegre etmek için oluşturulmuş bir yazılım değişiklikleri koleksiyonudur. NanoEngineer-1, Nanorex tarafından yazılmış bir moleküler CAD yazılımıdır ve kullanıcıya moleküller oluşturmanın kolay bir yolunu sunarken, yazılım modifikasyonları kullanıcının çoklu kuvvet alanları kullanarak atomları yazmasına izin verir. PACKMOL, NanoEngineer-1'den gelen molekül şablonlarını kullanarak rastgele bir molekül koleksiyonu oluşturabilir, böylece ilk MD hücresini sağlar. PACKMOL'deki değişiklikler, atom tipi verilerin MSI2LMP yazılımına iletilmesine izin verir. MSI2LMP, sınıf I veya sınıf II kuvvet alanlarını temel alan bir LAMMPS girdi dosyası oluşturur. MSI2LMP, NanoEngineer-1 tarafından oluşturulan sayısal olarak kodlanmış kuvvet alanı verilerini kullanacak şekilde değiştirildi. MMP dosya formatı genişletildi ve üç yazılım uygulamasına da entegre edildi.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Özellikler
- NanoEngineer-1 aracılığıyla moleküler CAD yeteneği
- CFF91 Atomistik kuvvet alanına dayalı olarak atomları manuel olarak yazın
- NanoEngineer-1 kullanarak molekül şablonları oluşturun
- PACKMOL ve çoklu molekül şablonları kullanarak bir MD hücresi oluşturun
- MSI2LMP kullanarak bir LAMMPS Geometri Girdi Dosyası oluşturun
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
OpenGL, Qt
Programlama dili
Fortran, Python, C++, C
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.