Bu, en son sürümü benchmark1-arabidopsis.thaliana-scripts.tar.gz olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalıştırılmak üzere skewer adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için skewer adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
Linux'ta çevrimiçi çalıştırmak için şiş
Ad
TANIM
Bu program, adaptör kırpma görevine adanmış yeni bir dinamik programlama algoritması uygular ve illumina eşleştirilmiş uç dizilerini işlemek için özel olarak tasarlanmıştır.Özellikler
- Adaptör dizilerinin algılanması ve kaldırılması
- Desen eşleştirmede ekleme ve silmeye izin verilir
- Tek Uç, Eşleştirilmiş Uç (PE) ve Uzun Montaj İlişkisi Çifti (LMP) okumalarında hedeflenir
- Barkodlu sıralama çalıştırmalarının çoğullanması
- Çoklu iş parçacığı desteği
- Phred kalite puanlarına dayalı kırpma
- Barkodlar ve adaptörler için IUPAC karakterleri
- Sıkıştırılmış giriş ve çıkış desteği
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
C + +
Bu, https://sourceforge.net/projects/skewer/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
