Bu, en son sürümü Virmid-1.2.0.tar.gz olarak indirilebilen Virmid adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
Virmid adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
virüslü
TANIM
HABERLER:
11-07-2013 Virmid 1.1.0'ın yeni bir sürümü yüklendi.
08-29-2013 Virmid makalesi şimdi Genome Biology'de yayınlandı.
Kim S ve diğerleri, "Virmid: numune safsızlığı çıkarımı ile somatik mutasyonların doğru tespiti", Genome Biology 2013, 14:R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (SNP çağrısı için Sanal Mikrodiseksiyon), hastalık kontrolü eşleştirilmiş örnekler için tasarlanmış Java tabanlı bir değişken arayandır. Virmid ayrıca hastalık örneğinin yeterince saflaştırılamadığı durumlarda bireysel kontaminasyon içindeki potansiyeli belirlemek için uzmanlaşmıştır. SNP arama hızı bu heterojenlik ile ciddi şekilde tehlikeye girerken, Virmid kontaminasyon seviyesini (alfa) dikkate alarak düşük alel frekansına sahip SNP'leri ortaya çıkarabilir. Virmid'in önemli özellikleri şunlardır:
• (Karışık) bir hastalık örneğinde kontrol örneğinin doğru orantısının tahmini
• Tahmini orana göre geliştirilmiş SNP ve somatik mutasyon çağrısı
Özellikler
- somatik mutasyon bulma
- Örnek kirlilik çıkarımı
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
Java
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/virmid/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
