Це команда bp_chaos_plotp, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн- емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
bp_chaos_plot - діаграма хаосу з послідовностей ДНК і РНК
СИНТАКСИС
bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=ВИХОДНИЙ ФАЙЛ -g/--graphics=ГРАФІЧНИЙ ФОРМАТ
-w/--width=WIGHT -h/--height=ВИСОТА
ОПИС
Цей сценарій створює файли зображень за допомогою бібліотеки зображень GD для візуалізації нуклеотидів
послідовності з використанням сюжету хаосу.
ВАРІАНТИ
На даний момент дійсними графічними форматами є gd, gd2, png, wbmp, jpeg та gif.
За замовчуванням розмір файлу зображення становить 600x400.
Введення послідовності можна надати будь-яким із трьох методів:
неназваний аргумент
bp_chaos_plot ім'я файлу
названий аргумент
bp_chaos_plot -i ім'я файлу
стандартний вхід
bp_chaos_plot < ім'я файлу
ЗВ'ЯЗОК
Розсилка списки
Відгуки користувачів є невід’ємною частиною розвитку цього та інших модулів Bioperl. Надіслати
Ваші коментарі та пропозиції бажано надсилати до списку розсилки Bioperl. Ваша участь
дуже цінується.
[захищено електронною поштою] - Загальне обговорення
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Про списки розсилки
Звітність Помилки
Повідомляйте про помилки в систему відстеження помилок Bioperl, щоб допомогти нам відстежувати помилки та їх
резолюція. Звіти про помилки можна надсилати через Інтернет:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
АВТОР - Jason Стаїч
Електронна адреса [захищено електронною поштою]
ІСТОРІЯ
Цей код заснований на коді EMBOSS C для chaos.c від Яна Лонгдена. Включені
документація з коду EMBOSS:
Хаос породжує сюжет хаосу. Оригінальна програма є частиною геному ACEDB
пакет бази даних, автор ** Річард Дурбін (MRC LMB, Великобританія) [захищено електронною поштою] та
Жан Тьєррі-Міг (CRBM du CNRS, Франція) [захищено електронною поштою]
Використовуйте bp_chaos_plotp онлайн за допомогою служб onworks.net
