Це команда bp_mrtransp, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн- емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
bp_mrtrans - реалізує трансформатор вирівнювань від білка до координат mrna
СИНТАКСИС
Використання:
bp_mrtrans -i вхідний файл -o вихідний файл [-if вхідний формат] [-формату виведення] [-s кДНК
база даних послідовностей] [-sf формат послідовності кДНК] [-h]
ОПИС
Цей сценарій перетворить вирівнювання білка назад у кДНК. На основі Білла
Мртранс Пірсона.
Варіанти:
-o filename - ім'я вихідного файлу [STDOUT за замовчуванням]
-of format - формат вихідної послідовності
(вирівнювання кількох послідовностей)
[за замовчуванням phylip]
-i filename - ім'я вхідного файлу [обов'язково]
-if format - формат вхідної послідовності
(вирівнювання кількох послідовностей)
[ clustalw за замовчуванням]
-s --seqdb filename - файл бази даних послідовності кДНК
-sf --seqformat - формат cDNA seq db (формат послідовності плоского файлу)
-h - це меню довідки
Використовуйте bp_mrtransp онлайн за допомогою служб onworks.net