Це команда cassiopee, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
cassiopee - сторінка посібника для Cassiopee версії 1.0
СИНТАКСИС
кассіопея [Options]
ОПИС
Використання:
-l: максимальна глибина індексу / максимальний розмір візерунка
-u: зберегти індекс для подальшого використання
-s: послідовність до індексу
-p: шаблон для пошуку
-f: файл, що містить шаблон для пошуку
-o: вихідний файл
-r: застосувати скорочення дерева
-m: режим пошуку: 0=ДНК, 1=РНК, 2=білок
-a: дозволити пошук неоднозначності в алфавіті
-n: максимум N поспіль дозволених збігів у пошуку
-e: максимальна кількість дозволених збігів у пошуку
-i: максимально дозволених збігів у пошуку
-g: створює точковий файл графіка
-d: максимальна глибина графіка
-t: формат виведення: 0:tsv (за замовчуванням), 1:json
-x: мінімальне положення в послідовності
-y: максимальне положення в послідовності
-v: показати версію
-h: показати це повідомлення
Використовуйте cassiopee онлайн за допомогою служб onworks.net
