Це команда EDTSurf, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
EDTSurf - швидке і точне побудова макромолекулярних поверхонь
СИНТАКСИС
EDTSurf -i pdbname...
ОПИС
EDTSurf — програма з відкритим кодом для створення тріангуляційних поверхонь для макромолекул. Це
створює три основні макромолекулярні поверхні: поверхню Ван-дер-Ваальса, доступну для розчинника
поверхня та молекулярна поверхня (поверхня без розчинника). EDTsurf також ідентифікує порожнини
які знаходяться всередині макромолекул.
ВАРІАНТИ
-o перейменування
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-чистий 2-атомний 3-ланцюг
-p радіус зонда [0,2.0]
-f масштабний коефіцієнт (0,20.0)
-h 1-вхід і вихід 2-вихід 3-в
вихід 1: outname.ply
вихід2: outname.asa
вихід3: outname-cav.pdb
Використовуйте EDTSurf онлайн за допомогою служб onworks.net
