Це команда existDB, яку можна запустити в безкоштовному хостинг-провайдері OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
existDB - керування файлами existDB
СИНТАКСИС
існує БД [- мерсайз mersize] -будувати some.fasta префікс
існує БД -описати префікс
існує БД - тестові файли some.fasta префікс
існує БД -тестоіснування some.fasta
існує БД -тествичерпний some.fasta some.meryl
ОПИС
Ця програма є частиною libkmer.
ВАРІАНТИ
- мерсайз mersize
Використовуйте зазначене mersize при будівництві існує БД столи.
-будувати some.fasta префікс
Побудувати існує БД на всіх mers в some.fasta і збережіть таблиці в префікс.
-описати префікс
Повідомляє про стан деяких існує БД файлу.
- тестові файли some.fasta префікс
Побудувати існує БД стіл з some.fasta. Запишіть цю таблицю на диск. Завантажте стіл
назад. Порівняйте кожен mer in some.fasta присутній у всіх трьох існує БД Таблиці
створений раніше.
-тестоіснування some.fasta
Побудувати існує БД стіл з some.fasta, перевірте, щоб кожен заходив some.fasta може бути
знайдено в таблиці. Не гарантує, що кожен mer у таблиці знайдено в
файлу.
-тествичерпний some.fasta some.meryl
Побудувати існує БД стіл з some.fasta, перевірте _КОЖЕН_ mer на існування. поскаржитися
якщо mer існує в таблиці, але не в Меріл(1) база даних. Припускає some.meryl
є mercount of some.fasta.
Використовуйте existDB онлайн за допомогою сервісів onworks.net
