Це команда fastaq-to_fasta, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
fastaq_to_fasta - перетворює різноманітні формати введення в добре відформатований формат FASTA
ОПИС
використання: fastaq_to_fasta [параметри]
Перетворює різноманітні формати введення в добре відформатований формат FASTA
позиційний аргументи:
infile Назва вхідного файлу. Може бути будь-яким із FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
вихідний файл
Ім'я вихідного файлу
необов'язковий аргументи:
-h, --допомога
показати це повідомлення довідки та вийти
-l LINE_LENGTH, --довжина_рядка LINE_LENGTH
Кількість баз у кожному рядку послідовності вихідного файлу. Встановити на нуль для немає
розриви рядків у послідовностях [60]
-s, --strip_after_whitespace
Видаліть все після першого пробілу в кожній назві послідовності
-u, --check_unique
Die, якщо будь-яка з назв вихідної послідовності не є унікальною
Використовуйте fastaq-to_fasta онлайн за допомогою служб onworks.net