fdk - Інтернет у хмарі

ПРОГРАМА:

ІМ'Я

fdk - конусно-променева реконструкція з проекцій за допомогою алгоритму FDK

Термін FDK відноситься до авторів Фельдкампа, Девіса і Кресса, які написали фундаментальну роботу
«Практичний алгоритм конусного променя» в 1984 році. Їхня стаття описує відфільтровану зворотну проекцію
алгоритм реконструкції конусно-балкової геометрії. Програма fdk у plastimatch є
реалізація алгоритму FDK.

ФДК ВИКОРИСТАННЯ

Програма fdk бере каталог із зображеннями 2D проекції як вхідні дані та створює один
Об’єм 3D як вихід.

Використання командного рядка:

Використання: fdk [параметри]
варіанти:
-Апаратне забезпечення або "cpu" або "cuda" (за замовчуванням=cpu)
-a "num ((num) num)" Використовуйте цей діапазон зображень
-r "r1 r2 r3" Встановити вихідну роздільну здатність (у вокселях)
-f фільтр "немає" або "рампа" (за замовчуванням = рампа)
-s scale Масштабувати інтенсивність вихідного файлу
-z "s1 s2 s3" Фізичний розмір реконструкції (у мм)
-I indir Вхідний каталог
-O вихідний файл Вихідний файл

Використання програми fdk найкраще зрозуміти, дотримуючись підручників:
fdk_tutorial_i та fdk_tutorial_ii.

ВХІД ФАЙЛИ

Підтримуються три різні формати вхідних файлів. Це:

· Файли зображень у форматі Pfm з файлами geomtry txt

· Файли зображень необробленого формату з файлами geomtry txt

· Файли Varian hnd

Файли pfm і raw подібні тим, що вони зберігають зображення у вигляді масиву з 4 байтів
плаває з малим порядком. Єдина відмінність полягає в тому, що файл pfm має заголовок, який зберігає
розмір зображення, а необроблений файл ні.

Кожен файл PFM або необробленого зображення повинен мати файл геометрії в тому самому каталозі з .txt
розширення. Наприклад, якщо ви хочете використовувати image_0000.pfm у реконструкції, ви повинні
надайте інший файл image_0000.txt, який містить геометрію. Короткий опис
вказано формат файлу геометрії proj_mat_file_format.

Послідовність файлів повинна зберігатися з шаблоном:
XXXXYYYY.ZZZ

де XXXX – префікс, YYYY – число, а .ZZZ – розширення відомого типу
(або .hnd, .pfm або .raw).

Наприклад, наступне було б хорошим макетом каталогу для файлів pfm:

Файли/image_00.pfm
Файли/image_00.txt
Файли/image_01.pfm
Файли/image_01.txt
і т.д. ..

Файли Varian hnd слід зберігати в оригінальному макеті. Наприклад:

Файли/ProjectionInfo.xml
Файли/Scan0/Proj_0000.hnd
Файли/Scan0/Proj_0001.hnd
і т.д. ..

Для відновлення з формату Varian hnd не потрібні файли txt геометрії.

IMAGE ГЕОМЕТРІЯ

За замовчуванням, коли ви створюєте DRR, зображення орієнтується як віртуальне джерело рентгенівського випромінювання
були камерою. Це означає, що для правої бічної плівки стовпці зображення йдуть від
inf до sup, а рядки переходять від мурахи до повідомлення. Система Varian OBI створює файли HND,
які по-різному орієнтовані. Для правої бічної плівки йдуть стовпці зображень HND
від мурашки до посади, а рядки йдуть від sup до inf. Показано ілюстрацію цієї ідеї
на малюнку нижче.
[зображення] Геометрія файлів Varian HND.UNINDENT

Використовуйте fdk онлайн за допомогою служб onworks.net