Це команда geneparse-mpi, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
geneparse - інтерфейс завантажувача файлів послідовності
СИНАПС
geneparse [параметри...] [вхід] [вхід2 ...] #читання введених даних і запис у стандартний вихід
ОПИС
Читає файл послідовності та записує його кудись (за замовчуванням у стандартний вихід).
Конкретний діапазон у вхідному файлі можна вказати за допомогою file[start,stop]. Квадрат
дужки можна поміняти місцями для будь-якого з {[()]}, (наприклад, "genome.fa[3000,4000]" або
"genome.fa{3000~4000}"). Майте на увазі, що все це може бути розібрано вашою оболонкою. Також
для розділення чисел можна використовувати будь-який символ, що не є словом.
ВАРІАНТИ
--repeatmask|-r
використовуйте послідовності з маскою м’якого повторення (тобто: замініть нижній регістр на N).
--верхній|--демаскувати|-U
у верхньому регістрі всі основи.
--довжина|-l
просто надрукуйте довжину та вийдіть
--чистий|-c
не додавайте новий рядок після завершення
--версія|-V
друкує версію програми
--допомога|-h
друкує довідкове повідомлення
--виведення|-o
відправити вихід у файл (інакше використовуйте стандартний вихід). --output означає --clean.
--тихий|-q
заглушити всі попередження
--дослівно|-v
друкує багато додаткових деталей
Використовуйте geneparse-mpi онлайн за допомогою служб onworks.net
