Це команда HPCmapper, яку можна запустити в безкоштовному хостинг-провайдері OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
HPCmapper - генерує сценарій для відображення читань
СИНТАКСИС
HPCmapper [-vb] [-kInt(20)] [-wInt(6)] [-hInt(50)] [-tInt] [-MInt]
[-eподвійний (.85)][-lInt(1000)] [-sInt(100)] [-HInt] [-mтрек]+ [-далInt(4)] [-градInt(25)]
ref:db|dam читається:db|dam [перший: int[-останній: інт]]
ОПИС
HPCmapper записує сценарій оболонки UNIX у стандартний вихід, який складається з послідовності
команди, які ефективно "відображають" кожне читання в БД читає проти еталонного набору
послідовності в БД посилання, записуючи всі знайдені локальні вирівнювання в послідовності файлів
реф.читає.1.лас, реф.читає.2.лас, і так далі, де реф.читає.к.лас містить вирівнювання
між усіма посилання і k-й блок читає. Параметри точно такі ж, як
та цінності HPCdaligner(1) зберегти, що -k, -h та -e за замовчуванням встановлено належним чином
картографування та -A та -I варіанти не мають сенсу, оскільки посилання та читає очікується, що вони будуть
різні набори даних.
Якщо цілі числа перший та останній відсутні, то створений скрипт призначений для кожного блоку в
базу даних читає. Якщо перший присутній тоді HPCmapper створює сценарій, який порівнює
Блоки перший через останній (останній = перший якщо немає) проти DAM посилання.
Використовуйте HPCmapper онлайн за допомогою сервісів onworks.net