англійськафранцузькаіспанська

Ad


Значок OnWorks

load_genbankp - Інтернет у хмарі

Запустіть load_genbankp у постачальника безкоштовного хостингу OnWorks через Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS

Це команда load_genbankp, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS

ПРОГРАМА:

ІМ'Я


load_genbank.pl - Завантажте базу даних Bio::DB::GFF з файлів GENBANK.

СИНТАКСИС


% load_genbank.pl -d genbank -f localfile.gb
% load_genbank.pl -d genbank -a AP003256

ПРИМІТКА: Сценарій bp_genbank2gff.pl у дистрибутиві BioPerl такий самий, як і цей сценарій.

ОПИС


Цей скрипт завантажує базу даних Bio::DB::GFF з функціями, що містяться в локальному файлі
файл genbank або приєднання, отримане з genbank. Різні параметри командного рядка
дозволяють контролювати, яку базу даних завантажувати та чи дозволяти існуючу базу даних
бути перезаписаним.

Наразі цей сценарій використовує лише MySQL, хоча він є доказом принципу і може легко
бути розширений для роботи з іншими RDMS, які підтримуються GFF через адаптери.

КОМАНДНИЙ РЯДОК ВАРІАНТИ


Параметри командного рядка можна скоротити до параметрів з однієї літери. наприклад -d замість
--база даних.

--create Примусове створення та ініціалізація бази даних
--dsn Джерело даних (за замовчуванням dbi:mysql:test)
--користувач Ім'я користувача для аутентифікації mysql
--пас Пароль для аутентифікації mysql
--проксі Проксі-сервер для віддаленого доступу
--file Аргументи, що наводяться далі, є іменами файлів Genbank/EMBL (за замовчуванням)
--accession Аргументи, що наводяться нижче, є номерами приєднання genbank
--stdout Запис конвертованого файлу GFF у stdout замість завантаження

Використовуйте load_genbankp онлайн за допомогою служб onworks.net


Безкоштовні сервери та робочі станції

Завантажте програми для Windows і Linux

  • 1
    OpenPDF - форк iText
    OpenPDF - форк iText
    OpenPDF - це бібліотека Java для створення
    і редагування файлів PDF за допомогою LGPL і
    Ліцензія з відкритим кодом MPL. OpenPDF - це
    LGPL/MPL з відкритим кодом наступник iText,
    має ...
    Завантажте OpenPDF - Fork of iText
  • 2
    SAGA GIS
    SAGA GIS
    SAGA - Система для автоматизації
    Географічні аналізи - це географічні
    Програмне забезпечення інформаційної системи (ГІС) с
    величезні можливості для геоданих
    обробка та ана...
    Завантажити SAGA GIS
  • 3
    Панель інструментів для Java/JTOpen
    Панель інструментів для Java/JTOpen
    IBM Toolbox для Java / JTOpen є a
    бібліотека класів Java, що підтримують
    програмування клієнт/сервер та Інтернет
    моделі до системи під керуванням OS/400,
    i5/OS, o...
    Завантажте Toolbox для Java/JTOpen
  • 4
    D3.js
    D3.js
    D3.js (або D3 для документів, керованих даними)
    це бібліотека JavaScript, яка дозволяє вам
    створювати динамічні інтерактивні дані
    візуалізації у веб-браузерах. З D3
    ти ...
    Завантажити D3.js
  • 5
    Тіні
    Тіні
    Швидкий тунельний проксі, який вам допоможе
    обхід брандмауерів Це програма
    з якого також можна отримати
    https://sourceforge.net/projects/shadowsocksgui/.
    Це ха...
    Завантажити Shadowsocks
  • 6
    Теми GLPI
    Теми GLPI
    Завантажити випуск за адресою
    https://github.com/stdonato/glpi-modifications/
    Колірні теми для GLPI 0.84 і 0.85 Новинка
    Модифікації для GLPI Це
    додаток, що c...
    Завантажте теми GLPI
  • Детальніше »

Команди Linux

Ad