Це команда maskseqe, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн- емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
maskseq - Напишіть послідовність із замаскованими областями
СИНТАКСИС
maskseq - послідовність послідовність -регіонів діапазон [-знизити переключитися] -маскар рядок
-outseq seqout
maskseq -допомога
ОПИС
maskseq — це програма командного рядка від EMBOSS («Європейська молекулярна біологія Open
Пакет програмного забезпечення»). Це частина команд (груп) «Редагувати».
ВАРІАНТИ
вхід розділ
- послідовність послідовність
Вимагається розділ
-регіонів діапазон
Регіони для маскування. Набір регіонів визначається набором пар позицій. The
позиції цілі числа. Вони розділені будь-яким нецифровим, не альфа-символом.
Приклади специфікацій регіону: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
Додатковий розділ
-знизити переключитися
Регіон можна «замаскувати», перетворюючи деякі символи послідовності в нижній регістр
Програми без EMBOSS, наприклад fasta, можуть інтерпретувати це як замасковану область. Послідовність є
без змін, крім зміни відмінка. Ви можете переконатися, що вся послідовність
у верхньому регістрі перед маскуванням зазначених областей у нижній регістр за допомогою
прапор «-вечеря». Значення за замовчуванням: N
-маскар рядок
Символ для маскування. За замовчуванням — «X» для білкових послідовностей, «N» для нуклеїнових
послідовності. Якщо символ маски встановлений як символ ПРОБІЛ або нульовий символ,
тоді послідовність «маскується», змінюючи її на нижній регістр, як і у випадку
прапорець '-нижнього регістру'. Значення за замовчуванням: @($(acdprotein)?X:N)
Вихід розділ
-outseq seqout
Використовуйте maskseqe онлайн за допомогою служб onworks.net
